Vliv "zaplňovacích" činidel na interakce DNA-tenzid

but.committeeprof. Ing. Miloslav Pekař, CSc. (předseda) prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (místopředseda) doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen) doc. Ing. Petr Dzik, Ph.D. (člen) prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (člen)cs
but.defencePekař: Kyselina akrylová nevedla k žádnému efektu? Jak si to vysvětlujete? Márová: Jaký je skutečný stav DNA v živé buňce a do jaké míry vaše zaplňovací činidla jsou schopné simulovat buňečné prostředí? Jak si vysvětlujete anomální signál při gelové elektroforéze? Jaký je rozsah DNA žebříčku? Jak byste dále upravila návrh experimentu, aby věrněji simuloval fyziologické prostředí? Zdráhal: Jaká byla obecná motivace pro tuto práci?cs
but.jazykangličtina (English)
but.programChemie pro medicínské aplikacecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorPekař, Miloslaven
dc.contributor.authorBačovská, Šárkaen
dc.contributor.refereeHurčíková, Andreaen
dc.date.created2017cs
dc.description.abstractTato diplomová práce se zabývá vlivem zaplňovacích činidel na interakce v systému DNA-tenzid. DNA o velikosti 4017 párů bází byla připravena polymerázovou řetězovou reakcí, jako templát byl použit plasmid pSB-E1g. Polyetylen glykol (PEG) byl použit jako zaplňovací činidlo a jeho vliv na DNA-tenzid interakce byl zkoumán experimenty založenými na fluorescenci a gelové elektroforéze. Také byl studován vliv iontové síly za použití NaBr na interakce DNA-tenzid za použití zaplňovacího činidla. Data byla vyhodnocena a evaluována v této práci. V úvahu byl brán i možný vliv polyetylen glykolu na kritickou micelarní koncentraci (CMC) tenzidu, bylo provedeno měření CMC pomocí ultrazvuku s vysokým rozlišením, avšak nebyl zjištěn žádný značný vliv zaplňovacího činidla na CMC tenzidu. Část této práce bude zahrnuta v publikaci s anglickým názvem Combined role of macromolecular crowding and cationic surfactant in efficient DNA condensation.en
dc.description.abstractThe diploma thesis focuses on DNA-surfactant interaction in crowding environment. DNA of 4017 base pair size was prepared using polymerase chain reaction and template plasmid pSB-E1g. The crowding environment was mimicked by polyethylene glycol and its effect on the interactions of DNA-surfactant system was investigated by dye exclusion study, electrophoretic mobility shift assay and DNase protection assay. Also the effect of ionic strength on DNA-surfactant interaction in crowding environment, using NaBr, was investigated. Data were evaluated and discussed in this work. The effect of crowding agent on surfactant CMC was studied using high resolution ultrasonic velocity. It was found that there is no significant effect of PEG on surfactant CMC. This work is going to be part of the scientific publication with title Combined role of macromolecular crowding and cationic surfactant in efficient DNA condensation.cs
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationBAČOVSKÁ, Š. Vliv "zaplňovacích" činidel na interakce DNA-tenzid [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2017.cs
dc.identifier.other91650cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/65031
dc.language.isoencs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemickács
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDNAen
dc.subjecttenziden
dc.subjectzaplňováníen
dc.subjectpolymerázová řetězová reakceen
dc.subjectfluorescenceen
dc.subjectgelová elektroforézaen
dc.subjectultrazvuk s vysokým rozlišenímen
dc.subjectDNAcs
dc.subjectsurfactantcs
dc.subjectcrowdingcs
dc.subjectpolymer chain reactioncs
dc.subjectfluorescence studycs
dc.subjectgel electrophoresiscs
dc.subjecthigh resolution ultrasonic spectroscopycs
dc.titleVliv "zaplňovacích" činidel na interakce DNA-tenziden
dc.title.alternativeEffect of crowding agents on DNA-surfactant interactioncs
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2017-06-06cs
dcterms.modified2017-06-07-12:33:35cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta chemickács
sync.item.dbid91650en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 09:50:59en
sync.item.modts2025.01.17 14:05:34en
thesis.disciplineChemie pro medicínské aplikacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav fyzikální a spotřební chemiecs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.48 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_91650.html
Size:
7.33 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_91650.html
Collections