Predikce vlivu aminokyselinových mutací na sekundární strukturu proteinů
| but.committee | prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D. (místopředseda) Ing. Vladimír Bartík, Ph.D. (člen) prof. Ing. Martin Drahanský, Ph.D. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Staudek, CSc. (člen) | cs |
| but.defence | Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A. Otázky u obhajoby: V sekcii 4.4 popisujete techniky odhadu optimálneho počtu mutačných krokov. Popíšte, akou metódou ste odvodili tieto počty v skúmaných datasetoch. | cs |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Informační technologie | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Bendl, Jaroslav | cs |
| dc.contributor.author | Hyrš, Martin | cs |
| dc.contributor.referee | Vogel, Ivan | cs |
| dc.date.created | 2013 | cs |
| dc.description.abstract | V této práci zkoumám, jak mutace aminokyselionové sekvence proteinu poznamená jeho sekundární strukturu. Zjistil jsem, že sekundární struktura je vůči mutacím poměrně odolná, některé úseky si udrľí svoji strukturu, i když jejich sekvence je zcela odlišná. Tato odolnost se projevuje i u náhodných sekvencí, je to tedy obecná vlastnost sekvencí aminokyselin. Jednotlivé konformace jsou ke změnám způsobeným mutací různě citlivé. Citlivost proteinu vůči mutacím závisí na složení jeho struktury. V počátečních kapitolách jsou popsány vybrané metody predikce sekundární struktury. | cs |
| dc.description.abstract | In this thesis I investigate the effect of amino acid substitutions on secondary structure of proteins. I found that the secondary structure is relatively resistant to mutations, some regions hold the same secondary structure, even though their sequences are very different. Since this effect was observed also for random sequences, I conclude that it is a general property of the amino acid sequence. The particular elements of secondary structures are differentially sensitive to the changes caused by mutations. Protein's sensitivity to mutations depends on the composition of its secondary structure. Some methods of secondary structure prediction are described in the introductory section. | en |
| dc.description.mark | A | cs |
| dc.identifier.citation | HYRŠ, M. Predikce vlivu aminokyselinových mutací na sekundární strukturu proteinů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2013. | cs |
| dc.identifier.other | 79185 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/53539 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | Mutace proteinů | cs |
| dc.subject | sekundární struktura proteinů | cs |
| dc.subject | evoluce in silico | cs |
| dc.subject | odolnost sekundární struktury vůči mutaci | cs |
| dc.subject | predikce sekundární struktury proteinu | cs |
| dc.subject | Proteins' mutations | en |
| dc.subject | secondary structure of proteins | en |
| dc.subject | evolution in silico | en |
| dc.subject | secondary structure resistance to a mutation | en |
| dc.subject | prediction of secondary structure of proteins | en |
| dc.title | Predikce vlivu aminokyselinových mutací na sekundární strukturu proteinů | cs |
| dc.title.alternative | Prediction of the Effect of Amino Acid Substitutions on Secondary Structure of Proteins | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | masterThesis | en |
| dc.type.evskp | diplomová práce | cs |
| dcterms.dateAccepted | 2013-06-19 | cs |
| dcterms.modified | 2020-05-09-23:43:31 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 79185 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2025.03.26 15:16:02 | en |
| sync.item.modts | 2025.01.15 15:54:11 | en |
| thesis.discipline | Bioinformatika a biocomputing | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémů | cs |
| thesis.level | Inženýrský | cs |
| thesis.name | Ing. | cs |