Automatické vyhlazení 3D modelů kraniální embryonální myší chrupavky

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D. (předseda) Ing. Helena Vítková, Ph.D. (místopředseda) Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (člen) Ing. Martin Lamoš, Ph.D. (člen) Ing. Jakub Hejč, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Harabiš položil otázku, jakou strukturu má reálně chrupavka? Ing. Lamoš položil otázku, jaké rozměry a velikost mají původní data? Ing. Hejč položil otázku, zda byly použity směrové masky pro filtraci? Studentka obhájila diplomovou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínské inženýrství a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorJakubíček, Romancs
dc.contributor.authorKočendová, Kateřinacs
dc.contributor.refereeHarabiš, Vratislavcs
dc.date.created2020cs
dc.description.abstractPráce je zaměřena na vyhlazování 3D modelů ručně segmentované kraniofaciální chrupavčité tkáně myších embryí. Při procesu ruční segmentace dochází ve výsledných modelech ke tvorbě artefaktů a nepřesností, které je potřeba korigovat. Nejprve je segmentace upravena pomocí gradientu a prahování. Následné vyhlazovací metody jsou sestrojeny na základě teoretické rešerše. Algoritmizace je provedena v prostředí MATLAB. Veškeré algoritmy jsou navrženy a otestovány na vybraných modelech. Statistické vyhodnocení je stanoveno pomocí Dice koeficientu, kde je jako zlatý standard používán ručně vyhlazený model, na kterém byly zredukovány veškeré artefakty.cs
dc.description.abstractThe focus of this thesis is the smoothing of manually segmented 3D models of mouse embryo craniofacial cartilege. During the process of manual segmentation, artefacts and other imperfections appear in the final models and need to be repaired. Firstly, manual segmentation is corrected using gradients and thresholding. Subsequent smoothing methods are constructed based on theoretical research. Algorithmizing is executed in the MATLAB environment. All the designed algorithms are then tested on selected models. Statistical evaluation is determined using the Srensen–Dice coefficient, where manually smoothened models cleared of all artefacts are used as the gold standard.en
dc.description.markDcs
dc.identifier.citationKOČENDOVÁ, K. Automatické vyhlazení 3D modelů kraniální embryonální myší chrupavky [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2020.cs
dc.identifier.other126839cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/189243
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subject3D modelcs
dc.subjectchrupavkacs
dc.subjectvyhlazenícs
dc.subjectbinárnícs
dc.subjectmaskacs
dc.subjecttomografiecs
dc.subjectmyšcs
dc.subjectembryocs
dc.subjectsegmentacecs
dc.subject3D modelen
dc.subjectcartilageen
dc.subjectsmoothingen
dc.subjectbinaryen
dc.subjectmasken
dc.subjecttomographyen
dc.subjectmiceen
dc.subjectembryoen
dc.subjectsegmentationen
dc.titleAutomatické vyhlazení 3D modelů kraniální embryonální myší chrupavkycs
dc.title.alternativeAutomatic smoothing 3D models of cranial embryonic mouse cartilageen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2020-06-16cs
dcterms.modified2020-06-19-13:01:39cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid126839en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 14:23:57en
sync.item.modts2025.01.17 13:58:55en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
18.73 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
3.8 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_126839.html
Size:
6.74 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_126839.html
Download
Collections
2020