Studium probiotických bakterií mléčného kvašení produkujících antimikrobiální látky

but.committeeprof. Ing. Peter Šimko, DrSc. (předseda) prof. Ing. Michal Rosenberg, Ph.D. (člen) prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (člen) doc. Ing. Jiřina Omelková, CSc. (člen) doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (člen) prof. MVDr. Ing. Petr Doležal, CSc., oponent (člen) prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc., oponent (člen)cs
but.defencePředseda komise představil doktorandku Ing. Turkovou a předal jí slovo. Následovala powerpointová prezentace, v níž doktorandka představila podstatné výsledky své práce. Doktorandka publikovala řadu článků v impaktovaných a také v recenzovaných časopisech. Zúčastnila se velkého množství konferencí. Oba oponentské posudky byly pozitivní a doporučovaly práci k obhajobě, viz. zhodnocení přínosu práce.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programChemie a technologie potravincs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorŠpanová, Alenacs
dc.contributor.authorTurková, Kristýnacs
dc.contributor.refereeDoležal, Petrcs
dc.contributor.refereeRada,, Vojtěchcs
dc.date.accessioned2019-06-14T11:02:21Z
dc.date.available2019-06-14T11:02:21Z
dc.date.created2014cs
dc.description.abstractSoubor 68 kmenů izolovaných ze stolice plně kojených dětí a dalších zdrojů byl identifikován pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) s primery specifickými pro rod Lactobacillus, druhově specifickými primery včetně multiplexní PCR, pheS PCR, rep-PCR, RAPD-PCR a srovnáním sekvencí genů pro 16SrRNA. Dále byla sledována produkce antimikrobiálních látek pomocí agarového kapkového testu a agarového difuzního testu. Antimikrobiální bílkovinné látky v dostatečné koncentraci v supernatantu produkovalo 7 kmenů. U vybraných 3 kmenů byl sledován vliv teploty, pH a přítomnosti detergentů na inhibiční vlastnosti supernatantu. Uvedené kmeny produkovaly teplotně stabilní antimikrobiální bílkovinné látky, jejichž antimikrobiální vlastnosti neovlivňovaly testované detergenty s výjimkou SDS. Skríning DNA na přítomnost genů pro produkci bakteriocinů pomocí PCR a DNA/DNA hybridizace ukázal jejich přítomnost u 14 kmenů. U 3 kmenů byly identifikovány geny shodné s geny v genových klastrech pro gassericin K7A nebo gassericin K7B. Specifické produkty PCR byly sekvenovány a analyzovány pomocí algoritmu BLAST a programu CLUSTAL W2. U 2 kmenů byla nalezena v databázi GeneBank 100% shoda nukleotidových sekvencí se sekvencemi pro části genových klastrů gassericinu K7B, gassericinu T a acidocinu LF221B. Kmeny skupiny Lactobacillus acidophilus byly dále testovány na odolnost vůči podmínkám gastrointestinálního traktu, na adhezi na Caco-2 buňky a na rezistenci vůči antibiotikům. Skríningem DNA všech kmenů pomocí specifických primerů byla zjištěna přítomnost genu pro produkci histidin dekarboxylázy u 7 kmenů, gen pro produkci tyrosin dekarboxylázy byl detegován u 1 kmene a gen pro linoleát izomerázu u 4 kmenů. Pomocí optimalizovaného postupu imunomagnetické separace buněk s využitím biotinylované protilátky anti-Lactobacillus a magnetických nosičů s navázaným streptavidinem byly buňky kmene L. rhamnosus LOCK 0900 separovány z tekutého MRS media, UHT mléka a bílého jogurtu v dostatečném množství pro detekci pomocí PCR.cs
dc.description.abstractThe sixty-eight strains isolated from breastfed full-term infant feces and from another sources were identified using genus-specific polymerase chain reaction (PCR) for Lactobacillus, species-specific PCRs, multiplex PCR, pheS PCR, rep-PCR, RAPD-PCR and 16S rDNA sequencing into Lactobacillus species or group of species. Seven strains produced antimicrobial proteinaceous substances in the supernatants. Antimicrobial proteinaceous substances of three strains were tested on temperature, pH a detergent stability. All tested strains produced temperature-stable antimicrobial proteinaceous substances. Antimicrobial activity was not influenced by detergents with exception of SDS. Presence of genes for production of bacteriocins (acidocin B, gassericin A, gassericin T, gassericin K7A and gassericin K7B) were detected in DNA of fourteen strains using PCR and DNA/DNA hybridization. Selected PCR products were sequenced and analyzed using BLAST algorithm and CLUSTAL W2 programme. The sequences of specific PCR products in DNA of two strains had 100% similarity with the sequences from the database GeneBank. Selected strains of Lactobacillus acidophilus group were tested for the surveillance in gastrointestinal tract, for the production of antimicrobial substances, for the adhesion on Caco-2 cells and for the presence of genes of antibiotic resistance. DNA of strains was tested using specific primers on the presence of genes for histidine-decarboxylase, tyrosine-decyrboxylase and linoleate isomerase. The gene for histidine-decarboxylase production was detected in DNA of seven strains, for tyrosine-decarboxylase production in DNA of one strain and for linoleate isomerase in DNA of four strains. Imunomagnetic separation of the cells was optimized. Magnetic particles functionalized with streptavidin and the anti-Lactobacillus antidote was used for the separation of the cells of Lactobacillus rhamnosus LOCK 0900 from MRS medium, UHT milk and from the yogurt. The IMS-PCR was used for detection of imunomagnetic separated bacterial cells.en
dc.description.markPcs
dc.identifier.citationTURKOVÁ, K. Studium probiotických bakterií mléčného kvašení produkujících antimikrobiální látky [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2014.cs
dc.identifier.other70027cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/35862
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemickács
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectLactobacilluscs
dc.subjectidentifikacecs
dc.subjectPCRcs
dc.subjectantimikrobiální látkycs
dc.subjectbakteriocinycs
dc.subjectprobiotické vlastnostics
dc.subjectimunomagnetická separace buněkcs
dc.subjectDNA/DNA hybridizacecs
dc.subjectLactobacillusen
dc.subjectidentificationen
dc.subjectPCRen
dc.subjectprobiotic propertiesen
dc.subjectantimicrobial substancesen
dc.subjectbacteriocinsen
dc.subjectimunomagnetic separationen
dc.subjectDNA/DNA hybridizationen
dc.titleStudium probiotických bakterií mléčného kvašení produkujících antimikrobiální látkycs
dc.title.alternativeStudy of Probiotic Lactic Acid Bacteria Producing Antimicrobial Compoundsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverdoctoralThesisen
dc.type.evskpdizertační prácecs
dcterms.dateAccepted2014-12-10cs
dcterms.modified2014-12-10-17:47:40cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta chemickács
sync.item.dbid70027en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2021.11.23 00:17:25en
sync.item.modts2021.11.22 23:44:21en
thesis.disciplinePotravinářská chemiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. Ústav chemie potravin a biotechnologiícs
thesis.levelDoktorskýcs
thesis.namePh.D.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 5 of 5
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
10.25 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
thesis-1.pdf
Size:
1.05 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
thesis-1.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Vedouci prace-Turkovavyjadreniskolitele1.pdf
Size:
26.96 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Vedouci prace-Turkovavyjadreniskolitele1.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-Rada_Turkova.pdf
Size:
196.06 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek-Oponent prace-Rada_Turkova.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_70027.html
Size:
14.09 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_70027.html
Collections