Identifikace variability v celogenomových sestaveních

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (předseda) Ing. Marina Ronzhina, Ph.D. (místopředseda) Ing. Radovan Smíšek (člen) Mgr. Bc. Darina Čejková, Ph.D. (člen) Ing. Jiří Sekora, MBA (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Mgr. Čejková se zeptala, proč studentka zvolila metodu UPGMA? Jaký referenční kmen jste zvolila? Jak se vyhodnocovala variabilita, když byly použity různé reference? Jak jste pojala nastavení variability v rámci jednoho genomu? Ing. Ronzhina se zeptala na aplikační využitelnost získaných výsledků. Ing. Sekora okomentoval seznam literatury a úroveň grafů. Studentka obhájila bakalářskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorBartoň, Vojtěchcs
dc.contributor.authorMorávková, Dalenacs
dc.contributor.refereeŠkutková, Helenacs
dc.date.accessioned2022-09-16T15:50:23Z
dc.date.available2022-09-16T15:50:23Z
dc.date.created2022cs
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá vyhledáváním variabilit v genomu organismu Treponema pallidum. V teoretické části jsou popsány významné sekvenační technologie, metody mapování genomu a variability genomu. Praktickou část tvoří mapování dat ze sekvenátoru Illumina, jejich zpracování a vyhledávání variabilních pozic.cs
dc.description.abstractThis bachelor thesis deals with searching variable positions in the Treponema Pallidum genome. The theoretical part describes sequencing technologies, methods of genome assembly and variability of genome. The practical part includes processing data sequenced by Illumina sequencing technology and identification of variability in them.en
dc.description.markEcs
dc.identifier.citationMORÁVKOVÁ, D. Identifikace variability v celogenomových sestaveních [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2022.cs
dc.identifier.other146038cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/208356
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectsekvenační technologiecs
dc.subjectNGScs
dc.subjectmapování genomucs
dc.subjectIlluminacs
dc.subjectBowtie2cs
dc.subjectgenetická variabilitacs
dc.subjectTreponema pallidumcs
dc.subjectsequencing technologyen
dc.subjectNGSen
dc.subjectgenome assemblyen
dc.subjectIlluminaen
dc.subjectBowtie2en
dc.subjectgenetic variabilityen
dc.subjectTreponema pallidumen
dc.titleIdentifikace variability v celogenomových sestaveníchcs
dc.title.alternativeVariability identification in whole-genome assembliesen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2022-08-30cs
dcterms.modified2022-08-31-08:16:35cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid146038en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2022.09.16 17:50:23en
sync.item.modts2022.09.16 16:12:39en
thesis.disciplinebez specializacecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
4.77 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
2.87 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_146038.html
Size:
5.51 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
review_146038.html
Download
Collections
2022