Preference synonymních kodonů v mitochondriálním genomu

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) prof. Ing. Martin Augustynek, Ph.D. (místopředseda) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) Ing. Jiří Sekora, MBA (člen) Ing. Vratislav Čmiel, Ph.D. (člen) Mgr. Veronika Bulková, Ph.D., MHA. (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Studentka obhájila bakalářskou práci s výhradami a odpověděla na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorUrbanová, Hedvikacs
dc.contributor.refereeCicková, Pavlínacs
dc.date.created2018cs
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá preferencí synonymních kodonů v mitochondriálním genomu. Jsou zde teoreticky rozebrány základní pojmy z oblastí bioinformatiky a genetiky. Kodonová preference je představena spolu s parametry, které ji charakterizují. Praktická část bakalářské práce se zabývá návrhem funkcí pro výpočet parametrů kodonové preference. Mezi naprogramovanými parametry je relativní četnost synonymních kodonů, relativní adaptační index, kodonový adaptační index a homozygotnost kodonů. Dále je provedena analýza kodonové preference u mitochondriálního genomu Homo sapiens.cs
dc.description.abstractThis Bachelors thesis deals with synonymous codon usage bias in mitochondrial genomes. This thesis covers basic terms of bioinformatics and genetics. Codon usage bias is introduced together with parameters that characterize it. Practical part of the thesis is dealing with programs that are designed to calculate parameters of codon usage bias. Programs that are described in this thesis are relative synonymous codon usage, relative adaptation index, codon adaptation index, homozygosity of codons, and effective number of codons. Synonymous codon usage bias in mitochondrial genome of Homo sapiens is analysed.en
dc.description.markCcs
dc.identifier.citationURBANOVÁ, H. Preference synonymních kodonů v mitochondriálním genomu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2018.cs
dc.identifier.other110539cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/82752
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectPreference kodonůcs
dc.subjectmitochondriální DNAcs
dc.subjectrelativní četnost synonymních kodonůcs
dc.subjectrelativní adaptační indexcs
dc.subjectkodonový adaptační indexcs
dc.subjecthomozygotnost kodonůcs
dc.subjectefektivní počet kodonůcs
dc.subjectCodon biasen
dc.subjectmitochondrial DNAen
dc.subjectrelative synonymous codon usageen
dc.subjectrelative adaptation indexen
dc.subjectcodon adaptation indexen
dc.subjecthomozygosity of codonsen
dc.subjecteffective number of codonsen
dc.titlePreference synonymních kodonů v mitochondriálním genomucs
dc.title.alternativeSynonymous codon usage bias in mitochondrial genomesen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2018-06-15cs
dcterms.modified2018-06-18-07:32:05cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid110539en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.17 00:18:58en
sync.item.modts2025.01.15 20:09:53en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.14 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
112.88 KB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_110539.html
Size:
5.2 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_110539.html
Download
Collections
2018