Aplikace pro zpracování dat z oblasti evoluční biologie

but.committeeprof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. Ing. Miroslav Švéda, CSc. (místopředseda) Ing. František Grézl, Ph.D. (člen) Ing. Martin Hrubý, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jiří Jaroš, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm E. Otázky u obhajoby: Byla již vytvořená aplikace použita biology pro jejich výzkum? Jakým způsobem byly zvoleny hodnoty parametrů pro testování validátoru (uvedené v tabulce 5.1)? Proč byly vybrány právě tyto hodnoty? Existují nějaké dostupné nástroje pro simulaci evoluce znaků podél fylogenetických stromů?cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorOčenášek, Pavelcs
dc.contributor.authorRadakovič, Lukášcs
dc.contributor.refereeBurgetová, Ivanacs
dc.date.created2015cs
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá návrhem a implementací aplikace, která má za úkol ověřit správnost algoritmu sloužícího na analýzu použitých mechanismů při tvorbě fylogenetického stromu. Aplikace umožňuje uživatelům zadat různé parametry fylogenetického stromu, jeho následné vytvoření a analýzu pomocí algoritmu. Výsledky analýzy se uloží do výstupního souboru, přičemž uživatel má možnost nastavit cestu. Zkoumaný algoritmus správně odhaduje podíl mechanismů na tvorbě stromu. Při odhadu relativního a absolutního podílu na změně počtu chromozomů a velikosti genomu nedosahuje přesné výsledky.cs
dc.description.abstractThis Bachelor’s thesis describes the design and implementation of the application that has the task to verify the accuracy of the algorithm. Purpose of the algorithm is to analyze mechanisms used in the creation of the phylogenetic tree. The application allows users to specify different parameters of phylogenetic tree, its generation and subsequent analysis using an algorithm. Results of the analysis are written to the output file, giving the user the option of setting file path. Studied algorithm correctly estimates the participation of specific mechanism in the tree formation. Estimates of the absolute and relative share of changes in chromosome number and genome size are less than accurate results.en
dc.description.markEcs
dc.identifier.citationRADAKOVIČ, L. Aplikace pro zpracování dat z oblasti evoluční biologie [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2015.cs
dc.identifier.other88744cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/52366
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectFylogenetický stromcs
dc.subjectaneuploidiecs
dc.subjectpolyploidiecs
dc.subjectproliferace DNAcs
dc.subjectodstranění DNAcs
dc.subjectrozpad chromozomůcs
dc.subjectspojení chromozomůcs
dc.subjectPhylogenetic treeen
dc.subjectaneuploidyen
dc.subjectpolyploidyen
dc.subjectproliferation of DNAen
dc.subjectremoval of DNAen
dc.subjectchromosome fissionen
dc.subjectchromosome fusionen
dc.titleAplikace pro zpracování dat z oblasti evoluční biologiecs
dc.title.alternativeApplication for the Data Processing in the Area of Evolutionary Biologyen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2015-06-15cs
dcterms.modified2020-05-10-16:12:10cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid88744en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.18 18:49:08en
sync.item.modts2025.01.15 15:14:58en
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 4 of 4
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
1.42 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Vedouci prace-17737_v.pdf
Size:
85.92 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file Posudek-Vedouci prace-17737_v.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Posudek-Oponent prace-17737_o.pdf
Size:
89.02 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
file Posudek-Oponent prace-17737_o.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_88744.html
Size:
1.46 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_88744.html
Collections