Vliv redukce nukleotidových denzitních vektorů na molekulární identifikaci organismů

Simple item page
but.committeedoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Aleš Drastich, CSc. (místopředseda) Ing. Denisa Maděránková, Ph.D. (člen) MUDr. Michal Jurajda, Ph.D. (člen) MUDr. Šárka Sekorová (člen)cs
but.defenceStudentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. doc. Kolář: Jak přesně probíhalo průměrování signálu v okně? Jaký byl použit filtr, jaká je jeho impulsní charakteristika? Proč se u některých případů projevuje závislost účinnosti na délce okna a na jiných ne? Ing. Maděránková: S jakými sekvencemi se pracovalo? Jaký je důvod použití právě mitochondriální DNA? Student obhájil bakalářskou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programBiomedicínská technika a bioinformatikacs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMaděránková, Denisacs
dc.contributor.authorKosková, Markétacs
dc.contributor.refereeProvazník, Valentýnacs
dc.date.created2014cs
dc.description.abstractTato práce se zabývá vlivem redukce nukleotidových denzitních vektorů na molekulární identifikaci organismů. Na začátku teoretické části je popsán pojem druh, jeho vývoj a s ním související mutace. V další časti je uvedena taxonomie, především ta molekulární, a DNA barcoding spolu s popisem mitochondriální DNA a jeho využitím k identifikaci druhů. Na konci teoretické části se nachází informace o nukleotidových denzitních vektorech, na které navazuje praktická část. V ní je pomocí Matlabu provedena analýza ošetření okrajů denzitních vektorů na 188 sekvencích. S nejlepší hodnotou je následně provedena identifikační analýza organismů a její vyhodnocení při použití denzitních vektorů pro jednotlivé nukleotidy a jejich sumy. To pro 4 soubory referenčních a 5 souborů analyzovaných sekvencí stejných druhů.cs
dc.description.abstractThis work deals with the effect of nucleotide density vector's reduction on molecular identification of organisms. At the beginning of the theoretical part, the work explains the concept of species, its development and its mutations. The next section provides basics of taxonomy, particularly the molecular taxonomy and DNA barcoding, with a description of mitochondrial DNA and its usability in the identification of species. The end of the theoretical part provides information about the nucleotide density vectors which the practical part is focused on. Analysis of auxiliary values on nucleotide density vectors was accomplished in Matlab by evaluating 188 real DNA barcode sequences. The identification analysis of organism was performed with the best auxiliary value for 4 datasets of the reference barcode sequences and 5 datasets of analyzed sequences of same organisms. Afterwards, the evaluation of the analysis was done by using separate nucleotide density vectors of individual nucleotides and their amounts.en
dc.description.markAcs
dc.identifier.citationKOSKOVÁ, M. Vliv redukce nukleotidových denzitních vektorů na molekulární identifikaci organismů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2014.cs
dc.identifier.other72828cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/33398
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectDruhcs
dc.subjectmolekulární taxonomiecs
dc.subjectDNA barcodingcs
dc.subjectnukleotidové denzitní vektory.cs
dc.subjectSpeciesen
dc.subjectmolecular taxonomyen
dc.subjectDNA barcodingen
dc.subjectnucleotide density vectors.en
dc.titleVliv redukce nukleotidových denzitních vektorů na molekulární identifikaci organismůcs
dc.title.alternativeEffect of nucleotide density vector's reduction on molecular identification of organismsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2014-06-19cs
dcterms.modified2014-06-20-10:10:43cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta elektrotechniky a komunikačních technologiícs
sync.item.dbid72828en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.16 13:29:57en
sync.item.modts2025.01.15 16:54:06en
thesis.disciplineBiomedicínská technika a bioinformatikacs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. Ústav biomedicínského inženýrstvícs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
2.11 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Download
Thumbnail Image
Name:
appendix-1.zip
Size:
5.75 MB
Format:
zip
Description:
appendix-1.zip
Download
Thumbnail Image
Name:
review_72828.html
Size:
4.24 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_72828.html
Download
Collections
2014