Akcelerace algoritmů pro porovnání biologických sekvencí s využitím FPGA
| but.committee | cs | |
| but.defence | cs | |
| but.jazyk | čeština (Czech) | |
| but.program | Informační technologie | cs |
| but.result | práce byla úspěšně obhájena | cs |
| dc.contributor.advisor | Martínek, Tomáš | cs |
| dc.contributor.author | Beck, Patrik | cs |
| dc.contributor.referee | Kořenek, Jan | cs |
| dc.date.accessioned | 2020-05-22T11:55:49Z | |
| dc.date.available | 2020-05-22T11:55:49Z | |
| dc.date.created | cs | |
| dc.description.abstract | Táto práca sa zaoberá implementáciou hardwarového zariadenia, ktoré porovnáva biologické sekvencie. Pri porovnávaní využíva algoritmy Smith-Waterman a Needleman-Wunsch. Zariadenie slúži ako akcelerátor bioinformatických algoritmov na vyššej úrovni. Príkladom využitia može byť analýza ľudského genómu, porovnávanie proteínu s databázou, odhaľovanie dedičných informácií. Dosiahnuté zrýchlenie sa v závislostí na danej úlohe, oproti bežnému PC pohybuje v niekoľkých rádoch. | cs |
| dc.description.abstract | This work describes implementation of hardware device for approximate string matching of biological sequences. Matchnig is performed using Smith-Waterman and Needleman-Wunsch algorithms. Device can be used as an accelerator for bioinformatics algorithms on higher level. This accelerator can be used for human genome analysis, matching proteins against a database, revealing inheritance information. Depending on task character, the acceleration speed up achieves several orders of magniture in comparison with conventional computers. | en |
| dc.description.mark | A | cs |
| dc.identifier.citation | BECK, P. Akcelerace algoritmů pro porovnání biologických sekvencí s využitím FPGA [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. . | cs |
| dc.identifier.other | 15181 | cs |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11012/56284 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií | cs |
| dc.rights | Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení | cs |
| dc.subject | FPGA | cs |
| dc.subject | približné porovnávanie ret'azcov | cs |
| dc.subject | FPGA | en |
| dc.subject | approximate string matching | en |
| dc.title | Akcelerace algoritmů pro porovnání biologických sekvencí s využitím FPGA | cs |
| dc.title.alternative | Acceleration of Algorithms for Approximate String Matching Using FPGA | en |
| dc.type | Text | cs |
| dc.type.driver | bachelorThesis | en |
| dc.type.evskp | bakalářská práce | cs |
| dcterms.modified | 2020-05-09-23:39:59 | cs |
| eprints.affiliatedInstitution.faculty | Fakulta informačních technologií | cs |
| sync.item.dbid | 15181 | en |
| sync.item.dbtype | ZP | en |
| sync.item.insts | 2020.05.22 13:55:49 | en |
| sync.item.modts | 2020.05.22 12:25:34 | en |
| thesis.discipline | Informační technologie | cs |
| thesis.grantor | Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémů | cs |
| thesis.level | Bakalářský | cs |
| thesis.name | Bc. | cs |