Konstrukce sufixových polí a jejich využití v bioinformatice

but.committeeprof. Ing. Václav Dvořák, DrSc. (předseda) doc. Ing. Vladimír Janoušek, Ph.D. (místopředseda) Ing. Vladimír Bartík, Ph.D. (člen) doc. Ing. Petr Matoušek, Ph.D., M.A. (člen) Ing. Aleš Smrčka, Ph.D. (člen)cs
but.defenceStudent nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázku oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm " B ". Otázky u obhajoby: V závěru práce uvádíte čtyři možnosti rozšíření vaši bakalářské práce. Máte nějaké ideje, jak by šlo těchto rozšíření dosáhnout? Pokud ano, stručně se je pokuste objasnit.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMartínek, Tomášcs
dc.contributor.authorHlávka, Ondřejcs
dc.contributor.refereeČermák, Martincs
dc.date.created2011cs
dc.description.abstractPráce pojednává o perspektivní datové struktuře, která se nazývá sufixové pole. Tato datová struktura je zde podrobněji popsána a v práci je dále uvedeno rozdělení algoritmů pro konstrukci tohoto pole. Je zde popsáno několik konstrukčních algoritmů a nejpodrobněji se práce zaobírá algoritmem nazývaným qsufsort. Nakonec si ukážeme využití sufixového pole pro vyhledávání přesných (pomocí binárního vyhledávání) a přibližných (metoda QUASAR) vzorů v sekvencích DNA.cs
dc.description.abstractThis work describes perspective data structure called suffix array. This data structure is described in more detail and this paper also contains taxonomy of suffix array construction algorithms. A few algorithms are described more precisely and most space is devoted to algorithm called qsufsort. Finally we will show how can be suffix array used in practice. This work shows usage of suffix array in exact (binary search) and approximate (QUASAR) string matching in DNA sequences.en
dc.description.markBcs
dc.identifier.citationHLÁVKA, O. Konstrukce sufixových polí a jejich využití v bioinformatice [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2011.cs
dc.identifier.other42759cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/55673
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsStandardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezenícs
dc.subjectSufixové polecs
dc.subjectsufixcs
dc.subjectpřesné vyhledávánícs
dc.subjectpřibližné vyhledávánícs
dc.subjectQUASARcs
dc.subjectqsufsortcs
dc.subjectSuffix arrayen
dc.subjectsuffixen
dc.subjectexact matchingen
dc.subjectapproximate matchingen
dc.subjectQUASARen
dc.subjectqsufsorten
dc.titleKonstrukce sufixových polí a jejich využití v bioinformaticecs
dc.title.alternativeSuffix Arrays Construction and Their Use in Bioinformaticsen
dc.typeTextcs
dc.type.driverbachelorThesisen
dc.type.evskpbakalářská prácecs
dcterms.dateAccepted2011-06-13cs
dcterms.modified2020-05-09-23:42:53cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid42759en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.18 17:49:37en
sync.item.modts2025.01.16 00:33:50en
thesis.disciplineInformační technologiecs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémůcs
thesis.levelBakalářskýcs
thesis.nameBc.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
Loading...
Thumbnail Image
Name:
final-thesis.pdf
Size:
959.72 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
final-thesis.pdf
Loading...
Thumbnail Image
Name:
review_42759.html
Size:
1.46 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_42759.html
Collections