Segmentace míšního kanálu a meziobratlových plotének v MRI datech

Abstract

Práca sa venuje vývoju metódy pre segmentáciu spinálneho kanálu a intervertebrálnych diskov v objemových MRI dátach. Cieľom je čo najvyšší stupeň automatizácie postupu a presnosť umožňujúca spoľahlivé kvantitatívne hodnotenie výsledkov. Základ segmentačného algoritmu tvorí model náhodnej prechádzky v kombinácii so špecifickou metódou aktívnych kontúr formulovanou prostredníctvom konceptu level set. Navrhnutý postup je testovaný na databáze trojrozmerných T2-váhovaných MRI snímok, ktorej súčasťou je aj referenčná manuálna segmentácia intervertebrálnych diskov.The concern of this thesis is development of the method for the spinal canal and intervertebral discs segmentation in volume MRI data. The primary aim is to achieve the highest possible level of automation and accuracy allowing for reliable quantitative evaluation of the results. The algorithm is based on the random walk model in combination with a specific active contour method formulated through level set concept. The proposed approach is tested using a database of three-dimensional T2-weighted MR images, which also contains referential manual segmentation of intervertebral discs.