Vyhledávání vazebních míst transkripčních faktorů

Simple item page
but.committeeprof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) prof. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D. (místopředseda) Ing. Vladimír Bartík, Ph.D. (člen) prof. Ing. Martin Drahanský, Ph.D. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) doc. Ing. Jan Staudek, CSc. (člen)cs
but.defenceStudent nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm D. Otázky u obhajoby: Popíšte, podľa akých kritérií sa vyberá tzv. "vzorové vazební místo" proteínu p53, ktoré spomínate v sekciách 6.2 a 6.3. Popíšte význam technológie ChIP-on-chip z pohľadu bioinformatiky.cs
but.jazykčeština (Czech)
but.programInformační technologiecs
but.resultpráce byla úspěšně obhájenacs
dc.contributor.advisorMartínek, Tomášcs
dc.contributor.authorHlávka, Ondřejcs
dc.contributor.refereeVogel, Ivancs
dc.date.available2014-06-19cs
dc.date.created2013cs
dc.description.abstractV dnešní době je v molekulární biologii velice důležité zkoumat mechanismus regulace genové exprese. Genová exprese je mimo jiné regulována pomocí transkripčních faktorů, které se vážou do specifických sekvencí v regulačních regionech genů. Vyhledávání těchto specifických sekvencí je náročné, protože tyto sekvence mohou být vysoce degenerativní. Existuje několik způsobů jak vyhledávání vazebních míst transkripčních faktorů realizovat. První část práce obsahuje popis algoritmů pro vyhledávání vazebních míst, zatímco ve druhé je popsán návrh a implementace vlastního řešení pro vyhledávání vazebních míst transkripčního faktoru p53.cs
dc.description.abstractNowadays, it is very important to study gene expression mechanism in molecular biology. Gene expression is also regulated by sequence specific transcription factors which binds to regulatory regions of the genes. Searching for this specific sequences can be very problematic because transcription factor binding sites can be very degenerative. There are several possible methods that can be aplied to this problem. First part of this paper describes few algorithms for transcription binding sites search. Second part contains design and implementation of algorithm for searching binding sites of transcription factor p53.en
dc.description.markDcs
dc.identifier.citationHLÁVKA, O. Vyhledávání vazebních míst transkripčních faktorů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2013.cs
dc.identifier.other79267cs
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11012/53518
dc.language.isocscs
dc.publisherVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologiícs
dc.rightsPřístup k plnému textu prostřednictvím internetu byl licenční smlouvou omezen na dobu 1 roku/letcs
dc.subjectTranskripční faktorcs
dc.subjectprotein p53cs
dc.subjectregulace genové expresecs
dc.subjectvyhledávání TFBScs
dc.subjectTranscription factoren
dc.subjectprotein p53en
dc.subjectgene regulationen
dc.subjectTFBS searchingen
dc.titleVyhledávání vazebních míst transkripčních faktorůcs
dc.title.alternativeDetection of Transcription Factor Binding Sitesen
dc.typeTextcs
dc.type.drivermasterThesisen
dc.type.evskpdiplomová prácecs
dcterms.dateAccepted2013-06-19cs
dcterms.modified2020-05-10-16:11:08cs
eprints.affiliatedInstitution.facultyFakulta informačních technologiícs
sync.item.dbid79267en
sync.item.dbtypeZPen
sync.item.insts2025.03.26 15:15:45en
sync.item.modts2025.01.17 11:58:32en
thesis.disciplineBioinformatika a biocomputingcs
thesis.grantorVysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav počítačových systémůcs
thesis.levelInženýrskýcs
thesis.nameIng.cs
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
review_79267.html
Size:
1.45 KB
Format:
Hypertext Markup Language
Description:
file review_79267.html
Download
Collections
2013