but.committee	prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) doc. Ing. František Zbořil, Ph.D. (místopředseda) Ing. Ivana Burgetová, Ph.D. (člen) doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D. (člen) doc. Ing. Tomáš Martínek, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Adam Rogalewicz, Ph.D. (člen)	cs
but.defence	Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm B. Otázky u obhajoby: V závěru kapitoly 7 uvádíte, že dosahujete lepších výsledků než RepeatExplorer, dokázal by jste to nějak kvantitativně vyjádřit?	cs
but.jazyk	čeština (Czech)
but.program	Informační technologie	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Puterová, Janka	cs
dc.contributor.author	Matocha, Petr	cs
dc.contributor.referee	Martínek, Tomáš	cs
dc.date.created	2017	cs
dc.description.abstract	Hlavním tématem této práce je detekce překryvů u NGS dat. Práce obsahuje přehled sekvenovacích technologií, jenž jsou zdrojem NGS dat. V práci je obecně definován problém detekce překryvů DNA sekvencí. Následně je v práci vytvořen přehled dostupných existujících algoritmů a přístupů pro detekci překryvů u NGS dat. Jsou zde popsány základní principy těchto algoritmů. V druhé části práce je navržen vhodný nástroj pro detekci přibližných překryvů u NGS dat a popsána jeho implementace. V závěru práce jsou shrnuty a popsány experimenty provedené s tímto nástrojem a závěry, které z nich vyplývají.	cs
dc.description.abstract	The main theme of this work is the detection of overlaps in NGS data. The work contains an overview of NGS sequencing technologies that are the source of NGS data. In the thesis, the problem of overlapping detection is generally defined. Next, an overview of the available algorithms and approaches for detecting overlaps in NGS data is created. Principles of these algorithms are described herein. In the second part of this work a suitable tool for detecting approximate overlaps in NGS data is designed and its implementation is described herein. In conclusion, the experiments performed with this tool and the conclusions that follow are summarized and described.	en
dc.description.mark	B	cs
dc.identifier.citation	MATOCHA, P. Efektivní hledání překryvů u NGS dat [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2017.	cs
dc.identifier.other	106215	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/69505
dc.language.iso	cs	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	překryvy	cs
dc.subject	detekce překryvů	cs
dc.subject	sekvenování DNA	cs
dc.subject	NGS data	cs
dc.subject	NGS technologie	cs
dc.subject	DNA	cs
dc.subject	genom	cs
dc.subject	read	cs
dc.subject	repetitivní elementy	cs
dc.subject	algoritmy pro detekci překryvů	cs
dc.subject	sufixové filtry	cs
dc.subject	FM-index	cs
dc.subject	overlaps	en
dc.subject	overlaps detection	en
dc.subject	DNA sequencing	en
dc.subject	NGS data	en
dc.subject	NGS technologies	en
dc.subject	DNA	en
dc.subject	genome	en
dc.subject	read	en
dc.subject	repetitive elements	en
dc.subject	algorithms for overlap detection	en
dc.subject	suffix filters	en
dc.subject	FM-index	en
dc.title	Efektivní hledání překryvů u NGS dat	cs
dc.title.alternative	Effective Search for Overlaps in NGS Data	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	masterThesis	en
dc.type.evskp	diplomová práce	cs
dcterms.dateAccepted	2017-06-21	cs
dcterms.modified	2020-05-10-16:12:52	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta informačních technologií	cs
sync.item.dbid	106215	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2025.03.26 15:24:38	en
sync.item.modts	2025.01.15 22:01:03	en
thesis.discipline	Bioinformatika a biocomputing	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémů	cs
thesis.level	Inženýrský	cs
thesis.name	Ing.	cs

Efektivní hledání překryvů u NGS dat

Files

Original bundle

Collections