but.committee	prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (předseda) doc. Ing. Jiří Jaroš, Ph.D. (místopředseda) doc. Ing. Vítězslav Beran, Ph.D. (člen) doc. Mgr. Lukáš Holík, Ph.D. (člen) Ing. Zbyněk Křivka, Ph.D. (člen)	cs
but.defence	Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se poté seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázky oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A. Otázky u obhajoby: Vo vyhodnotení uvádzate, že dátová sada, na ktorej bol trénovaný nástroj OptSolMut, zdieľala značné množstvo príkladov s dátovou sadou na ktorej bol tento nástroj testovaný. Neskúšal ste tento nástroj znovu trénovať, tak aby k prieniku trénovacej a testovacej sady nedochádzalo ? Ak nástroj nie je možné pretrénovať, akým spôsobom by bolo možné sa s týmto problémom vyrovnať a získať porovnanie Vášho riešenia s metódou OptSolMut ? Je vaše řešení založeno na použití existujících modulů vhodně složených dohromady s cílem vyřešit vaši úlohu nebo jste vytvářel zcela nové metody? Jak pracujete s existujícími články? Využíval jste vlastní metody prohledávání struktur? Můžete uvést příklad mutace?	cs
but.jazyk	slovenština (Slovak)
but.program	Informační technologie	cs
but.result	práce byla úspěšně obhájena	cs
dc.contributor.advisor	Hon, Jiří	sk
dc.contributor.author	Marko, Július	sk
dc.contributor.referee	Smatana, Stanislav	sk
dc.date.created	2020	cs
dc.description.abstract	Rozpustnosť proteínov je kľúčový problém, ktorý úzko súvisí s požiadavkou na výrobu funkčného proteínu. Prediktor vplyvu mutácie na rozpustnosť proteínov by mohol viesť k značnému šetreniu času a financií, pretože je schopný in silico predikcie mutácií, ktoré zlepšujú rozpustnosť ešte pred zahájením hlbokého mutačného testovania v laboratóriu. V tejto práci je prezentovaný nový prediktor vplyvu mutácie na rozpustnosť proteínov SoluProtMut, založený na metódach strojového učenia. Väčšina existujúcich nástrojov predikujú tento vplyv zo sekvencie aminokyselín. Okrem tejto sekvencie, prediktor prezentovaný v tejto práci využíva aj priestorovú štruktúru proteínu, čím sa môže výrazne zvýšiť jeho presnosť.	sk
dc.description.abstract	Protein solubility is a key problem in production of functional proteins. Prediction of the effect of mutation on protein solubility could save a lot of time and money, as it would provide in silico prediction of solubility enhancing mutations before performing deep mutational scanning in laboratory. In this work, new predictor of the effect of mutation on protein solubility SoluProtMut is introduced that is based on machine learning methods. Most of the existing predictors predict the effect from the amino acid sequence. In addition to the sequence, the tool presented in this work also uses the spatial structure of the protein, which can significantly increase it's accuracy.	en
dc.description.mark	A	cs
dc.identifier.citation	MARKO, J. Predikce vlivu mutace na rozpustnost proteinů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2020.	cs
dc.identifier.other	129218	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/11012/191568
dc.language.iso	sk	cs
dc.publisher	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií	cs
dc.rights	Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení	cs
dc.subject	rozpustnosť	sk
dc.subject	proteín	sk
dc.subject	mutácia	sk
dc.subject	predikcia	sk
dc.subject	strojové učenie	sk
dc.subject	SoluProtMut	sk
dc.subject	solubility	en
dc.subject	protein	en
dc.subject	mutation	en
dc.subject	prediction	en
dc.subject	machine learning	en
dc.subject	SoluProtMut	en
dc.title	Predikce vlivu mutace na rozpustnost proteinů	sk
dc.title.alternative	Prediction of the Effect of Mutation on Protein Solubility	en
dc.type	Text	cs
dc.type.driver	bachelorThesis	en
dc.type.evskp	bakalářská práce	cs
dcterms.dateAccepted	2020-07-13	cs
dcterms.modified	2020-07-13-23:43:55	cs
eprints.affiliatedInstitution.faculty	Fakulta informačních technologií	cs
sync.item.dbid	129218	en
sync.item.dbtype	ZP	en
sync.item.insts	2025.03.18 19:31:09	en
sync.item.modts	2025.01.15 15:20:52	en
thesis.discipline	Informační technologie	cs
thesis.grantor	Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. Ústav informačních systémů	cs
thesis.level	Bakalářský	cs
thesis.name	Bc.	cs

Predikce vlivu mutace na rozpustnost proteinů

Files

Original bundle

Collections