Klasifikace metagenomických vzorků s využitím číslicového zpracování genomických signálů

Loading...
Thumbnail Image

Date

Authors

Najbr, Filip

Mark

E

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií

ORCID

Abstract

Cílem této práce je využití metod sloužících k číselnému zpracování genomických signálů a následná tvorba programu, který pomocí těchto metod, vytvoří vhodnou numerickou reprezentaci metagenomických vzorků, vyextrahuje z ní vhodé příznaky a pomocí nich rozliší jedince zdravé a jedince s onemocněním diabetes mellitus 2. typu za použití metod strojového učení.
The aim of this thesis is the use of methods for numerical processing of genomic signals and the subsequent creation of a program, which by using these methods creates a suitable numerical representation of metagenomic samples, extracts appropriate features and classifies healthy individuals and individuals with type 2 diabetes mellitus using machine learning methods.

Description

Citation

NAJBR, F. Klasifikace metagenomických vzorků s využitím číslicového zpracování genomických signálů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2018.

Document type

Document version

Date of access to the full text

Language of document

en

Study field

Biomedicínská technika a bioinformatika

Comittee

doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (předseda) Ing. Vratislav Harabiš, Ph.D. (místopředseda) Ing. Jan Odstrčilík, Ph.D. (člen) Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (člen) Ing. Martin Mézl, Ph.D. (člen) MUDr. Tibor Stračina, Ph.D. (člen)

Date of acceptance

2018-06-14

Defence

Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Ronzhina položila otázku: Proč se lišil počet deskriptorů u jednotlivých pacientů? Kolik vstupů bylo použito u neuronové sítě? Byla data rozdělena na trénovací a testovací množinu? Ing. Janoušek položil otázku: Na základě čeho jste zvolil deskriptory? Student obhájil bakalářskou práci s výhradami a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.

Result of defence

práce byla úspěšně obhájena

DOI

Collections

Endorsement

Review

Supplemented By

Referenced By

Citace PRO