JEŘÁBKOVÁ, P. Studium vlastností biologického materiálu pomocí metod obrazové analýzy [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2010.

Posudky

Posudek vedoucího

Zmeškal, Oldřich

Ing. Petra |Jeřábková se zabývala řešením disertační práce od roku 2003, první tři roky jako student presenčního studia, zbývající dobu jako student kombinovaného studia. Realizovala několik typů experimentů - zjišťování počtu a velikosti buněk, studium růstu a dělení buněk a studium umírání buněk. Pro každý z uvedených experimentů navrhla matematický postup vyhodnocení, ověřila ho na modelových datech a poté aplikovala na reálná data. Její přínos k řešené problematice spatřuji ve všech třech uvedených oblastech. V průběhu doktorského studia aktivně přispěla ke vzniku dvou zahraničních publikací: příspěvku v monografii "Complexus Mundi", a příspěvku v časopise "Journal of Imaging Science and Technology". Kromě toho je spoluautorem několika příspěvků v časopise "Chemické listy" a několika příspěvků ve sbornících zahraničních a tuzemských konferencí, kde výsledky své práce prezentovala formou přednášek. Předepsané zkoušky skládala v souladu se stanoveným plánem, státní závěrečnou zkoušku složila do tří let od zahájení doktorského studia. V době presenčního studia se podílela i na pedagogické činnosti. V době kombinovaného studia pracovala dva roky jako vědecký pracovník na projektech řešených na FCH VUT, v současné době pracuje na SAV v Bratislavě. Doporučuji proto postoupit disertační práci, kterou vypracovala Ing. Petra Jeřábková k obhajobě ve studijním odboru "Fyzikální chemie" a po úspěšné obhajobě jí udělit titul Ph.D.

Navrhovaná známka

Posudek oponenta

Mikula, Milan

Predložená práca po formálnej stránke predstavuje 140 strán uceleného textu na danú tému s obrazovou prílohou, so štandardným usporiadaním kapitol týkajúcich sa súčasného stavu poznania v oblasti metrologie buniek a obrazovej analýzy na báze integrálnych transformácií, experimentu, výsledkov a ich diskusie. Rozsah práce je primeraný, kapitoly a výklad v logickom slede. Autorka sa opiera o 82 dobre zacielených literárnych citácií a o 10 prác (1 CC), na ktorých je spoluautorkou (v 7 prípadoch prvou autorkou), čo svedčí o jej výraznom podiele. Dve z týchto prác sú priložené ako príloha dizertačnej práce. Teoretická časť je veľmi dobre spracovaným úvodným materiálom jednak do oblasti biologických disperzií so živými rozvíjajúcimi sa bunkami a ich metrológie, ako i do oblasti využitia integrálnych transformácií pre účely obrazovej analýzy. Aktuálnosť zvolenej témy Obrazová analýza veľkej množiny objektov a kvantifikácia parametrov množiny, (počet, distribúcia, tvar,..) včítane sledovania a charakterizácie časového vývoja systému, je veľmi aktuálna, najmä ak sa vylúčia, alebo potlačia subjektívne a časovo náročné manuálne operácie. Z tohto pohľadu je využitie fraktálnej analýzy na charakterizáciu procesov (v tomto prípade biologických) veľmi aktuálne. Splnenie cieľov dizertácie Ciele sú rámcovo definované v Zadaní dizertačnej práce na prvej strane, ako využitie metód obrazovej analýzy k štúdiu rastu a životaschopnosti buniek. Bližšie rozpracovanie a definovanie cieľov však chýba, i keď sa dá vyrozumieť z riešenia témy. Definovanie cieľov, napr. na záver teoretického vstupu, je všeobecne zaužívané i v zahraničí pri podobných prácach. S ohľadom na veľmi úspešne rozpracovanú a aplikovanú metodiku fraktálnej obrazovej analýzy na štúdium vývoja disperzného mikrobiologického systému konštatujem, že ciele uvedené v zadaní práce boli splnené. Metódy spracovania problematiky Experimentálne metódy sledovania vývoja biologických systémov, ako i excelentné matematické spracovanie dát boli vhodne zvolené, správne aplikované a interpretované. Okrem štandardných postupov sa využila i netradičná metóda vlnkovej analýzy využívajúcej Haarovu trasformáciu. Výsledky dizertačnej práce s uvedením nových poznatkov a prínos pre ďalší rozvoj vedy a techniky Výsledky štúdií potvrdzujú, že použitá fraktálová analýza je vhodná pre charakterizáciu disperzného systému. Fraktálna miera a dimenzia majú vysokú výpovednú hodnotu a korelujú s fyzikálnymi vlastnosťami disperzného systému. Frekvenčné distribúcie umožňujú hľadať nové súvislosti a majú predikatívny charakter. Dá sa predpokladať, že sa vyvinuté metódy a postupy sa dajú aplikovať i na nebiologické disperzné systémy. Použité postupy nevyužívajú manuálne operácie s obrazom, čím sa odstraňuje subjektívnosť, znižuje časová náročnosť analýzy a umožňuje automatizácia merania a kontroly procesu. Formálne prevedenie Práca má veľmi dobrú formálnu úroveň, Text je zrozumiteľný, logicky formulovaný a dobre čitateľný so štandardnou grafickou úrovňou. Oceňujem najmä hladké spracovanie úvodu do obrazovej analýzy s využitím integrálnych transformácií. Citácie sú kompletné, podrobné a jednotne spracované i keď nie bežne zaužívaným spôsobom. Prvá priložená publikácia nie je definovaná (kde bola publikovaná). Záverom môžem konštatovať, že predložená práca spĺňa všetky nároky kladené na dizertačnú prácu, využíva priliehavé, aktuálne metodiky, splnila vytýčené ciele a prináša nové poznatky z vybranej oblasti. Preto odporúčam, po úspešnej obhajobe, prijať prácu ako dizertačnú a udeliť kandidátke Ing. Petre Jeřábkovej vedecko-akademickú hodnosť PhD.

Navrhovaná známka

Otázky

eVSKP id 32640