FOLTANOVÁ, K. Vliv přírodních látek z čaje na G-quadruplexy a vazebné a transaktivační vlastnosti proteinu p53 [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2023.

Posudky

Posudek vedoucího

Brázda, Václav

Ve své bakalářské práci se Klára Foltanová věnovala studiu vlivu přírodních látek na G-kvadruplexy. V rámci své práce zvládla celou řady biofyzikálních a molekulárně biologických technik včetně práce s kvasinkovým expresním systémem. Kladně tak hodnotím její aktivní přístup, který jí umožnil získání zajímavých výsledků. Bakalářskou práci vypracovala samostatně a prokázala dobrou orientaci v literatuře a řešené problematice a své zkušenosti jistě využije při dalším studiu. odpovídají bakalářské úrovni a pro úspěšné zvládnutí celé řady metodik a její aktivní přístup studentku hodnotím jako výbornou - A.

Dílčí hodnocení
Kritérium Známka Body Slovní hodnocení
Kvalita zpracování výsledků A
Interpretace výsledků, jejich diskuse A
Závěry práce a jejich formulace A
Využívání konzultací při řešení práce A
Celkový přístup k řešení úkolů A
Splnění požadavků zadání A
Studium literatury a její zpracování A
Využití poznatků z literatury A
Navrhovaná známka
A

Posudek oponenta

Řeháková, Veronika

Studentka Klára Foltanová se ve své bakalářské práci věnuje vlivu přírodních čajových látek na G-kvadruplexy a na vazebené a transaktivační vlastnosti proteinu p53. Téma, které reflektuje roli proteinu p53 v buněčném cyklu nádorových buněk, je vysoce aktuální. Teoretická část práce se věnuje struktuře a vlastnostem G-kvadruplexů, dále se pak zaměřuje na vlastnosti a vazebné aktivity proteinu p53 a v závěru teoretické části práce jsou diskutovány přírodní čajové látky, které interagují s G-kvadruplexy; konkrétně kyselina gallová a apigenin. Teoretická část bakalářské práce je spíše stručnější a obsahuje nemalé množství stylistických chyb (z textu občas vypadávají slova, často je chybně namísto pomlčky používán spojovník atp.). Nicméně i přes to se domnívám, že teoretická část poskytuje dostatečný a kvalitní podklad pro pochopení dané problematiky. Základem literární rešerše je celkem 73 převážně aktuálních zdrojů, které jsou správně a úplně citovány. Experimentální část bakalářské práce se věnuje nejprve izolaci plasmidové DNA z bakteriálních buněk E. coli a její transformaci do kvasinkového expresního systému. Následně byl proveden ThT kompetiční test, kde byla ověřena schopnost vazby G4-ligandů na vybrané syntetické oligonukleotidy, které vykazují schopnost tvorby G-kvadruplexů. Poté byl testován vliv G4-ligandů na životaschopnost kvasinkových buněk a byla zvolena nejvyšší možná koncentrace G4-ligandů, při které jsou kvasinky ještě schopny růstu. Závěr bakalářské práce je věnován luciferázovému reportérovému testu, s jehož pomocí byl sledován vliv přírodních G-ligandů na transaktivační vlastnosti proteinu p53. Výsledky experimentální části práce jsou diskutovány a zpracovány formou grafů. I přes to, že nedošlo k úplnému potvrzení hypotézy (zvolené koncentrace G4-ligandů pravděpodobně nemají výrazný vliv na transaktivaci proteinu p53), autorka velmi dobře argumentuje a získané výsledky jsou hojně komentovány. Kvalitu této části práce bohužel snižuje několik nedostatků. U většiny grafů chybí uvedení směrodatných odchylek (Obr. 8-11 a Obr. 16-19) a u některých z nich dokonce vypadl popis osy Y (Obr. 16-19). U obrázku 23 došlo k prohození popisků jednotlivých dat, není možné tak identifikovat jednotlivá data a graf tak ztrácí hodnotu. Nutno podotknout, že daná závěrečná práce může pro čtenáře, kteří se běžně nesetkávají s danou problematikou, působit poněkud chaotickým dojmem. Pomohlo by například uvedení využívané zkratky pro daný komponent/mikroorganismus nejprve v textu, než je použita například v tabulce nebo v grafu (např. zkratka P-K pro kvasinkový kmen Saccharomyces cerevisiae PUMA-KSHV nebo zkratka 315 pro prázdný plasmidový vektor apod.). I přes výše komentované nedostatky se domnívám, že se stále jedná o jedinečnou a kvalitní práci, která poskytuje hodnotná data důležitá pro další výzkum v této oblasti. Práci tak doporučuji k obhajobě a hodnotím stupněm B.

Dílčí hodnocení
Kritérium Známka Body Slovní hodnocení
Splnění požadavků zadání A
Logické členění práce A
Kvalita zpracování výsledků C
Využití literatury a její citace A
Úroveň jazykového zpracování B
Formální úroveň práce – celkový dojem B
Interpretace výsledků, jejich diskuse A
Závěry práce a jejich formulace A
Navrhovaná známka
B

Otázky

eVSKP id 148390