Epidemiologické modelování šíření nemoci Covid-19

Abstract

Tato práce se zabývá spojitými epidemiologickými deterministickými kompartmentovými modely a specifickými rysy modelování pandemie COVID-19. Numericky je studována rozdílnost různých pravděpodobnostních rozdělení setrvání jedinců v kompartmentech na základní reprodukční číslo, respektive konečnou velikost epidemie. Je navržen nový model pro retrospektivní analýzu epidemiologických dat ze severní Itálie první poloviny roku 2020. Odhad parametrů modelu je proveden minimalizací sumy váhovaných čtvercových reziduí a prohledávaní prostoru parametrů implementací algoritmu BFGS.This thesis deals with the continuous epidemiological deterministic compartmental models and the COVID-19 pandemic modeling distinctive features. The effect of different probability distributions of individuals stay in compartments is studied numerically in relation to basic reproductive number and the final size of the epidemic, respectively. New model for a retrospective analysis of the first half of 2020 northern Italy epidemiological data is proposed. The model parameters estimation is performed using minimisation of weighted sum of squared residuals and the search through parameter space with BFGS algorithm implementation.