PCR identifikace nepatogenních bakterií izolovaných ze sýrů
Loading...
Date
Authors
Jurečková, Nela
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract
Různé druhy rodu Bifidobacterium jsou součástí běžné střevní flóry lidí i zvířat. Jsou známé pro svůj prospěšný vliv na zdraví a proto je lze využít v potravinách a farmaceutických produktech jako probiotika. Mimo jogurty a fermentovaná mléka lze nyní využít i sýr jako potravinový nosič probiotických bakterií. Tato diplomová práce byla zaměřena na optimalizaci izolace bakterií rodu Bifidobacterium. K izolaci DNA byly použity magnetického částice (P(HEMA-co¬-GMA)) v přítomnosti 8% polyethylenglykolu PEG 6000 a 5 M chloridu sodného a metoda fenolové extrakce s následným přesrážením ethanolem. Izolovaná DNA pak byla použita v doménově, rodově i druhově specifických PCR. Metoda optimalizovaná pro průkaz bakterií rodu Bifidobacterium v tvrdých sýrech byla testována na experimentálně připravených probiotických sýrech, které obsahovaly potenciální probiotické bakterie ze sbírky Laktoflóra. Tyto bakterie byly zařazeny do druhu pomocí PCR s druhově specifickými primery. Ve všech vzorcích probiotických sýrů byla prokázána přítomnost bakterií druhu Bifidobacterium animalis.
Different species of genus Bifidobacterium are part of human and animal intestinal flora. These bacteria have benefit effects and therefore they are used in foods and pharmaceutical products as probiotics. Cheese is now suitable as a probiotic matrix except yoghurts and fermentated milks. This diploma thesis was focused on optimalization of DNA isolation from bacteria of genus Bifidobacterium. Magnetic microparticles (P(HEMA-co¬-GMA)) were used for DNA isolation in presence of 8% polyethyleneglycol PEG 6000 and 5 M sodium chloride. Phenol extraction weas also used as an isolation method. Isolated DNA was used for amplification in domain, genus and species specific PCRs. Optimized method was tested for detection of bacteria of genus Bifidobacterium in experimentaly prepared probiotic cheeses. These cheeses contained potential probiotic bacteria from Laktoflóra collection. Bacteria were identified into species using species specific PCR. Species Bifidobacterium animalis was identified in all samples of probiotic cheeses.
Different species of genus Bifidobacterium are part of human and animal intestinal flora. These bacteria have benefit effects and therefore they are used in foods and pharmaceutical products as probiotics. Cheese is now suitable as a probiotic matrix except yoghurts and fermentated milks. This diploma thesis was focused on optimalization of DNA isolation from bacteria of genus Bifidobacterium. Magnetic microparticles (P(HEMA-co¬-GMA)) were used for DNA isolation in presence of 8% polyethyleneglycol PEG 6000 and 5 M sodium chloride. Phenol extraction weas also used as an isolation method. Isolated DNA was used for amplification in domain, genus and species specific PCRs. Optimized method was tested for detection of bacteria of genus Bifidobacterium in experimentaly prepared probiotic cheeses. These cheeses contained potential probiotic bacteria from Laktoflóra collection. Bacteria were identified into species using species specific PCR. Species Bifidobacterium animalis was identified in all samples of probiotic cheeses.
Description
Citation
JUREČKOVÁ, N. PCR identifikace nepatogenních bakterií izolovaných ze sýrů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2010.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Potravinářská chemie a biotechnologie
Comittee
prof. Ing. Peter Šimko, DrSc. (předseda)
doc. Ing. Jiřina Omelková, CSc. (místopředseda)
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (člen)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (člen)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (člen)
Date of acceptance
2010-06-09
Defence
1. Diplomantka seznámila členy komise s náplní a cílem diplomové práce.
2. Byly přečteny posudky na diplomovou práci.
3. Diplomantka akceptovala všechny připomínky oponenta a na všechny otázky odpověděla v plné šíři.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení