Molekulární identifikace vybraných probiotických bakterií v různých druzích sýrů s využitím techniky real-time PCR a analýzy křivek tání (HRM)
Loading...
Date
Authors
Klaška, Dominik
ORCID
Advisor
Referee
Mark
B
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract
Práce byla zaměřena na průkaz probiotických bakterií ve čtyřech komerčně dostupných sýrech (čedar, eidam, ementál a gouda). DNA byla izolována fenolovou extrakcí a komerčním kitem. Pomocí spektrofotometru byla u izolované DNA prokázána dostatečná koncentrace i kvalita pro další analýzu pomocí PCR v reálném čase a vysokorozlišovací analýzy křivek tání. K amplifikaci pomocí real-time PCR byly použity druhově specifické primery. Ve výrobcích byla zkoumána přítomnost sedmi různých bakterií z rodů Lactobacillus, Lactococcus, Propionibacterium a Streptococcus.
The study aimed to detect probiotic bacteria in four commercially available cheeses (cheddar, edam, emmental and gouda). DNA was isolated by phenol extraction and a commercial kit. Using a spectrophotometer, the isolated DNA demonstrated sufficient concentration and quality for futher analysis by real-time PCR and high-resolution melt analysis. Species specific primers were employed for real-time PCR amplification. The presence of seven different bacterial species from the genera Lactobacillus, Lactococcus, Propionibacterium and Streptococcus was investigated in the cheese products.
The study aimed to detect probiotic bacteria in four commercially available cheeses (cheddar, edam, emmental and gouda). DNA was isolated by phenol extraction and a commercial kit. Using a spectrophotometer, the isolated DNA demonstrated sufficient concentration and quality for futher analysis by real-time PCR and high-resolution melt analysis. Species specific primers were employed for real-time PCR amplification. The presence of seven different bacterial species from the genera Lactobacillus, Lactococcus, Propionibacterium and Streptococcus was investigated in the cheese products.
Description
Citation
KLAŠKA, D. Molekulární identifikace vybraných probiotických bakterií v různých druzích sýrů s využitím techniky real-time PCR a analýzy křivek tání (HRM) [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2023.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
bez specializace
Comittee
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc. (předseda)
prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D. (místopředseda)
doc. Ing. Pavel Diviš, Ph.D. (člen)
prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D. (člen)
doc. RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D. (člen)
prof. Ing. Stanislav Kráčmar, DrSc. (člen)
Date of acceptance
2023-05-26
Defence
1. Student seznámil členy komise s náplní a cílem diplomové práce.
2. Byly přečteny posudky na diplomovou práci.
3. Student akceptoval všechny připomínky oponenta a na všechny otázky odpověděl v plné šíři.
Diskuse:
prof. RNDr. Ivana Márová, CSc.
V práci jste využívali analýzu křivek tání, která umožnuje i rozlišování na úrovni druhu mikroorganismů, využíval jste tuto analýzu pro rozlišení na úrovni druhu? Nebo jste se zabývali pouze rodovým rozlišením?
Jaké druhy mikroorganismů jste očekával v sýrových produktech? Odkud jste informace čerpal?
prof. Ing. Stanislav Obruča, Ph.D.
Jaká byla motivace Vaší práce? Vyskytují se v sýrech života schopné bakterie?
Narazil jste při studiu literatury třeba na probiotický sýr?
doc. RNDr. Renata Mikulíková, Ph.D.
Který z Vámi použitých sýru se nejvíce konzumuje?
doc. Ing. Eva Vítová, Ph.D.
Zmínil jste, že jste dané kultury našel v literatuře, ale jaké kultury mají sýry obsahovat?
V práci uvádíte, že sýr typu eidam, gouda a čedar patří do holandského typu, je to správné tvrzení? Který z nich se liší?
Student odpověděl na všechny doplňující otázky členů komise, které byly v průběhu diskuse k dané problematice vzneseny. V diskusi student prokázal velmi dobrou orientaci v dané problematice. Po diskusi následovalo hodnocení závěrečné práce. Diplomant prokázal nejen velmi dobré odborné znalosti, ale i schopnost samostatné prezentace dosažených výsledků.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení