Software pro automatickou extrakci dat k analýze mozkové konektivity

Abstract

Mozek; složitý systém, o kterém chce lidstvo hodně vědět, ale stále toho ví velmi málo. S rozvojem moderní techniky se veřejnosti dostává nových neurozobrazovacích metod, mezi nimiž má své místo i magnetická rezonance. Nestačí již však zobrazovat pouze strukturní povahu mozku, vědci se stále více zabývají funkčními stavy - výborně jim k tomu slouží funkční magnetická rezonance. Zkoumají se jednotlivé oblasti, ale také komunikace napříč mozkem, aby tak byly objasněny příčiny lidského chování a funkčních poruch. Tato práce se věnuje zkoumání mozkové konektivity, využívá parcelaci dle anatomických atlasů a pokouší se zavést znalosti teorie grafů jako jednu z možností určení vztahů mezi mozkovými centry a oblastmi. Práce představuje vytvořený software pro extrakci matice konektivity a následné zpracování a vizualizaci grafu.The brain; complex system people want to know about but still they are at the beginning of understanding it. There has been a lot of neuroimaging systems since developement of modern technologies and magnetic resonance imaging is one of them. In last days it isn't enough to examine only structural character of brain, the scientists are dealing with functional states more and more; the functional magnetic resonance imaging is perfectly good tool for this. There is a big amount of researches concerning individual brain regions but also a lot of them dealing with communication across the brain to clear up the causes of human behavior and functional failures. This thesis introduces the brain connectivity exploration, it uses the parcellation by anatomical atlases and it tries to use the knowledge of graph theory as one of the options to determine relations between brain centres and regions. The thesis introduces the software created for extraction of connectivity matrix resulting in graph processing and visualization.