Databázový systém pro správu biologických dat
Loading...
Date
Authors
Drlík, Radovan
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstract
Práce se zabývá problematikou uchovávání a správy biologických dat, především enzymů halogenalkan dehalogenáz. Dále se zaměřuje na projekt HADES (HAloalkane DEhalogenase databaSe) iniciovaný proteinovými inženýry Loschmidtových laboratoří Masarykovy univerzity v Brně. Jedná se o projekt, jehož hlavním cílem je jednoduše ukládat, uchovávat a zobrazovat různorodá data o proteinech. Výsledkem práce je flexibilní databázový systém umožňující snadnou rozšiřitelnost a udržovatelnost, který je postavený na technologiích Apache, PostgreSQL a PHP s využitím Zend Frameworku.
This thesis describes the problems of storage and management of biological data, particularly of Haloalkane Dehalogenase enzymes. Furthermore, the thesis aims at project HADES (HAloalkane DEhalogenase databaSe) initiated by protein engineering group of Loschmidt Laboratories, Masaryk University in Brno. This is a project whose main goal is simply to store, preserve and display a wide variety of proteins data. The result of this work is a flexible database system allowing easy extensibility and maintainability, which is built on technologies Apache, PostgreSQL and PHP using the Zend Framework.
This thesis describes the problems of storage and management of biological data, particularly of Haloalkane Dehalogenase enzymes. Furthermore, the thesis aims at project HADES (HAloalkane DEhalogenase databaSe) initiated by protein engineering group of Loschmidt Laboratories, Masaryk University in Brno. This is a project whose main goal is simply to store, preserve and display a wide variety of proteins data. The result of this work is a flexible database system allowing easy extensibility and maintainability, which is built on technologies Apache, PostgreSQL and PHP using the Zend Framework.
Description
Keywords
bioinformatika, molekulární biologie, proteiny, enzymy, halogenalkan dehalogenázy, Zend Framework, MySQL, PostgreSQL, Office Open XML, Entity-Attribute-Value model, bioinformatics, molecular biology, proteins, enzymes, Haloalkane Dehalogenases, Zend Framework, MySQL, PostgreSQL, Office Open XML, Entity-Attribute-Value model
Citation
DRLÍK, R. Databázový systém pro správu biologických dat [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií. 2010.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Informační systémy
Comittee
doc. Dr. Ing. Dušan Kolář (předseda)
prof. Ing. Miroslav Švéda, CSc. (místopředseda)
Ing. Šárka Květoňová, Ph.D. (člen)
doc. Mgr. Adam Rogalewicz, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Jiří Rybička, Dr. (člen)
prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2010-06-18
Defence
Student nejprve prezentoval výsledky, kterých dosáhl v rámci své práce. Komise se pak seznámila s hodnocením vedoucího a posudkem oponenta práce. Student následně odpověděl na otázku oponenta a na další otázky přítomných. Komise se na základě posudku oponenta, hodnocení vedoucího, přednesené prezentace a odpovědí studenta na položené otázky rozhodla práci hodnotit stupněm A. Otázky u obhajoby: Vysvětlete rozdíl mezi modelem Entity-Attribute-Value a Vámi navrženým systémem entit a atributů. Budou výsledky Vaší práce dále využívány?
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení