Modelování dynamiky buněčných kolonií
Loading...
Date
Authors
Bělehrádek, Stanislav
ORCID
Advisor
Referee
Mark
A
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Obsahem diplomové práce je popis intracelulárních procesů zodpovědných za řízení buněčného cyklu a reakce buněk na vnější i vnitřní podněty. Popsány jsou důležité signální dráhy a metody, kterými je lze simulovat in silico. Z popsaných buněčných dějů je vytvořen model buněčného cyklu, který je implementován do nástroje naprogramovaném v C++ s využitím OpenGL pro vizualizaci. Model je otestován pro různé buněčné procesy a pro růst buněk HeLa. Výsledky jsou nakonec porovnány s chováním živých buněk.
The content of the thesis is a description of intracellular processes responsible for cell cycle regulation and reactions of cells to external and internal stimuli. Thoroughly described are important signaling pathways with appropriate methods, which can be used to simulate them in silico. From these cellular processes, a cell cycle model is created and implemented in a tool programmed in C ++ with OpenGL used for visualization. The model is then tested for various cell processes including HeLa cells growth. Finally, the results are compared with the behavior of living cells.
The content of the thesis is a description of intracellular processes responsible for cell cycle regulation and reactions of cells to external and internal stimuli. Thoroughly described are important signaling pathways with appropriate methods, which can be used to simulate them in silico. From these cellular processes, a cell cycle model is created and implemented in a tool programmed in C ++ with OpenGL used for visualization. The model is then tested for various cell processes including HeLa cells growth. Finally, the results are compared with the behavior of living cells.
Description
Citation
BĚLEHRÁDEK, S. Modelování dynamiky buněčných kolonií [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2017.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
cs
Study field
Biomedicínské inženýrství a bioinformatika
Comittee
prof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D. (předseda)
doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (místopředseda)
RNDr. Petr Fuchs, Ph.D. (člen)
doc. Ing. Jana Drbohlavová, Ph.D. (člen)
Ing. Helena Vítková, Ph.D. (člen)
Ing. Jan Červený, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2017-06-07
Defence
Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Ing. Škutková položila otázku: Probíhá práce ve spolupráci s některou institucí? Prof. Provazník položil otázku: Byl program testován na superpočítači? Proč apoptóza nebyla vidět? Ing. Červený položil otázku: Jak jste řešil dostupnost živin při simulaci Petriho misky? Bral jste Petriho misku jako bodový nebo plošný zdroj? RNDr. Fuchs položil otázku: Jak jste odvodil vzorce pro směr a velikost pohybu podle energií od buňky a k buňce? Student obhájil diplomovou práci a odpověděl na otázky členů komise a oponenta.
Result of defence
práce byla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení