Klasifikace vzorků 1D gelové elektroforézy

Loading...
Thumbnail Image

Date

Authors

Krupka, Ondřej

Mark

B

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií

ORCID

Abstract

Tato diplomová práce se zabývá klasifikací vzorků 1D gelové elektroforézy. Popisuje teoretické informace týkající se gelové elektroforézy, různým druhům rušení, zpracování obrazu a jeho klasifikace pomocí shlukové analýzy. Jeden z hlavních úkolů je vytvoření databáze obrazů s ohledem na jejich co nejvyšší obrazovou kvalitu. Je realizována metoda předzpracování a detekce hranic jednotlivých vzorků v prostředí MATLAB. A konečně, je realizována klasifikace na základě shlukové analýzy vzorků, které je posléze statisticky ohodnocena.
This term project deals with the classification of 1D gel electrophoresis samples. It describes the theoretical information about gel electrophoresis, various types of errors, processing of the image and its classification using the cluster analysis. One of the main goals is creation of images with the highest quality as possible. A realization of pre-processing and detection of the sample borders is made in the MATLAB environment. And finally, classification of samples is done with subsequent statistical analysis.

Description

Citation

KRUPKA, O. Klasifikace vzorků 1D gelové elektroforézy [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.

Document type

Document version

Date of access to the full text

Language of document

cs

Study field

Biomedicínské inženýrství a bioinformatika

Comittee

prof. Ewaryst Tkacz, Ph.D.,D.Sc. (předseda) Ing. Martin Vítek, Ph.D. (místopředseda) doc. Ing. Jana Kolářová, Ph.D. (člen) Ing. Jan Červený, Ph.D. (člen) Mgr. Helena Durnová, Ph.D. (člen)

Date of acceptance

2015-06-09

Defence

Student prezentoval výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Doc. Kolářová položila otázku: Záleží umístění molekul na jejich velikosti? Jak? Jaká musí být vlastnost použitého gelu, aby metoda elektroforézy funguvala? Ing. Červený položil otázku: Používal jste nějaky standard při tvorbě vzorků? Student odpověděl na otázky členů komise a oponenta. Student obhájil diplomovou práci.

Result of defence

práce byla úspěšně obhájena

DOI

Collections

Endorsement

Review

Supplemented By

Referenced By

Citace PRO