Vizualizace 3D dat v biomedicínských aplikacích

Abstract

Tato práce popisuje základní princip optické koherentní tomografie a předzpracování na- měřených surových dat. Předzpracování je zaměřeno zejména na filtraci šumu, odstranění artefaktů, normalizaci, konverzi a kompresi surových dat. Takto předzpracovaná data jsou uložena do souboru *.PFRG jako ”preprocessed fringe data”. Tato předzpracovaná data je možno vizualizovat pomocí jednoduchého programu, který umožňuje zobrazení dat třemi způsoby. Objemová data reprezentována voxely. Rekonstrukce objemu algoritmem pochodující kostky. Řezy objektem podél os X, Y, a Z.This thesis describes the basic principle of optical coherence tomography and prepro- cessing of the measured raw data. Preprocessing is focused mainly on noise filtration, removing artifacts, normalization, conversion and compression of raw data. In this way preprocessed data is saved in a *. PFRG file as ”preprocessed fringe data”. Those pre- processed data will be visualised by simply software, which support three methods of visualisation. Volume data represented by voxels. Reconstruction of volume by marching cube algorithm. Cuts through volume along X, Y and Z axis.