Stanovení profilu antibiotické rezistence u hybridně sestavených bakteriálních genomů
Loading...
Date
Authors
Dzurčaninová, Natália
ORCID
Advisor
Referee
Mark
B
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract
Antibiotická rezistencia je vážny problém vo väčšine spôsobený zmenami v bakteriálnom genóme. Získavanie a uchovávanie spoľahlivých bakteriálnych genomických dát je preto nevyhnutné pre štúdium mechanizmov a prenosu antibiotickej rezistencie. Táto práca popisuje bakteriálny genóm, antibiotickú rezistenciu a nástroje pre jej identifikáciu spolu s procesmi nevyhnutnými pre zisk genómov, sekvenáciu a skladanie. Sústreďuje sa na hybridné skladanie genómov spravidla vysoko rezistentných baktérií Klebsiella pneumoniae a ich nasledujúcich analýz. Cieľom týchto analýz je skonštruovať profily antibiotických rezistencií a určiť fylogenetickú príbuznosť genómov.
Antibiotic resistance is a severe problem largely caused by changes in bacterial genome. The acquisition and storage of reliable bacterial genomic data is, therefore, vital for the study of mechanisms and transfer of antibiotic resistance. This thesis describes bacterial genome, antibiotic resistance and tools for its identification along with processes necessary for genome acquisition, sequencing and assembly. It focuses on hybrid assembly of genomes of generally highly resistant bacteria Klebsiella pneumoniae and subsequent analysis of this genomes. The purpose of the analysis is construction of antibiotic resistance profiles and determination of phylogenetic relatedness between the genomes.
Antibiotic resistance is a severe problem largely caused by changes in bacterial genome. The acquisition and storage of reliable bacterial genomic data is, therefore, vital for the study of mechanisms and transfer of antibiotic resistance. This thesis describes bacterial genome, antibiotic resistance and tools for its identification along with processes necessary for genome acquisition, sequencing and assembly. It focuses on hybrid assembly of genomes of generally highly resistant bacteria Klebsiella pneumoniae and subsequent analysis of this genomes. The purpose of the analysis is construction of antibiotic resistance profiles and determination of phylogenetic relatedness between the genomes.
Description
Citation
DZURČANINOVÁ, N. Stanovení profilu antibiotické rezistence u hybridně sestavených bakteriálních genomů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2023.
Document type
Document version
Date of access to the full text
Language of document
en
Study field
bez specializace
Comittee
prof. Ing. Martin Černý, Ph.D. (předseda)
Ing. Lukáš Smital, Ph.D. (místopředseda)
MUDr. Zuzana Nováková, Ph.D. (člen)
Ing. Helena Vítková, Ph.D. (člen)
Ing. Jiří Sekora, MBA (člen)
doc. Mgr. Zdenka Fohlerová, Ph.D. (člen)
Date of acceptance
2023-06-14
Defence
Studentka prezentovala výsledky své práce a komise byla seznámena s posudky. Studentka měla možnost vyjádřit se k posudkům. Všechny body zadání nebyly splněny. Studentka neobhájila bakalářskou práci. Komise doporučuje doplnit práci bez změny zadání a umožňuje obhajobu v nejbližším možném termínu.
Result of defence
práce nebyla úspěšně obhájena
Document licence
Standardní licenční smlouva - přístup k plnému textu bez omezení