SITKOVÁ, B. Studium interakcí mutantních forem nádorového supresoru p53 s různými DNA strukturními motivy [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2026.
Diplomová práce Blanky Sitkové vykazuje velmi nízkou míru shody s jinými dokumenty (pod 5 %), což svědčí o vysoké originalitě zpracování. Práce je zaměřena na studium interakcí proteinu p53 a jeho mutantních forem s nekanonickými strukturami DNA, zejména G kvadruplexy a křížovými strukturami, a kombinuje rozsáhlou teoretickou část s precizně provedenou experimentální částí. Studentka úspěšně zvládla celou řadu metodik zahrnující izolaci a purifikaci proteinů, EMSA, AFM i luciferázové reportérové testy a prokázala schopnost samostatného řešení komplexních úloh a interpretace výsledků. Bylo prokázáno, že všechny studované varianty p53 se vážou na různé DNA struktury a že významnou roli v těchto interakcích hraje C terminální doména proteinu, přičemž mutantní formy vykazují odlišnou afinitu i funkční aktivitu. Výsledky jsou přehledně prezentovány a diskutovány v kontextu současné literatury a přinášejí cenné poznatky pro pochopení regulační role p53 a jeho mutací v nádorové biologii. Práce je metodicky kvalitní, logicky strukturovaná a má potenciál dalšího využití v oblasti studia protein-DNA interakcí. Práce splňuje všechny požadavky kladené na diplomovou práci, doporučuji ji k obhajobě a navrhuji hodnocení výborně (A).
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | B | ||
| Využití poznatků z literatury | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | B | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | A |
Diplomová práce Bc. Blanky Sitkové se zabývá studiem interakcí mutantních forem nádorového supresoru p53 s různými strukturními motivy DNA, konkrétně G-kvadruplexy a křížovými strukturami. Studentka prokázala schopnost orientace v odborné literatuře i zvládnutí řady experimentálně náročných metod, jako jsou elektroforetické testy posunu mobility, mikroskopie atomárních sil či luciferázové reportérové testy v kvasinkových systémech. Práce je logicky členěna a jednotlivé kapitoly na sebe vhodně navazují. Teoretická část poskytuje přehledné shrnutí problematiky struktury a biologické role proteinu p53 i nekanonických struktur DNA. Experimentální část je zpracována přehledně a výsledky jsou vhodně doplněny fotkami gelů, mikroskopickými snímky a grafy. Oceňuji zejména propojení více experimentálních přístupů a snahu interpretovat výsledky v kontextu publikovaných studií. K práci mám pouze několik drobných připomínek. Teoretická část je místy velmi detailní a občas sklouzává k popisnosti. V obrázku 5.3.1 se (A) a (B) jeví jako totožné, což pravděpodobně nastalo nedopatřením při finalizaci dat. Bylo by vhodné tuto skutečnost objasnit při obhajobě. Z jazykového hlediska se v práci objevují drobné nepřesnosti (př. nekonzistentní značení – BL21 Codon+ vs. BL21-CodonPlus, byla odebráno, blotovací roztok vs. blotovací pufr), které však nijak nesnižují celkovou odbornou úroveň práce. Celkově hodnotím diplomovou práci jako velmi kvalitní, odborně přínosnou a experimentálně rozsáhlou. Diplomovou práci doporučuji k obhajobě a navrhuji hodnocení stupněm A.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Logické členění práce | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | A | ||
| Využití literatury a její citace | A | ||
| Úroveň jazykového zpracování | A | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A |
eVSKP id 156578