Program je umisten ve slozce Program
Vstupni obrazy jsou umisteny ve slozce Data -> vstupni data (pouze na CD - v elektronicky odevzdane verzi je tato slozka prazdna)
Referencni kontury jsou umisteny ve slozce Reference.


Pro spusteni programu otevrete slozku Program a v MATLABu otevrete soubor spust.m (nikoliv spust.fig).
Otevreny soubor pote spustte. Otevre se graficke uzivatelske rozhrani, ktere uzivatele naviguje pomoci napovedy v dolni casti panelu.


Vsechny data a algoritmy jsou umisteny (na prilozenem CD) tak, aby fungovaly automatizovane a bezproblemove. 
Z tohoto duvodu je nezadouci jakymkoli zpusobem menit nazvy slozek a souboru a jejich umisteni (slozku Programova_cast je vhodne presouvat a chovat se k ni jako k celku).
V pripade zmeny umisteni a pripadne nazvu nekterych souboru pak muze dochazet k problemum, nutnosti rucne zadat nektere soubory, v krajnim pripadne i k chybam.


V pripade nedostupnosti vstupnich obrazu (pri pouziti elektronicky odevzdanych priloh), je mozne vstupni obrazy HRF a DRIONS databazi stahnout zde:
HRF:		https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/
DRIONS:		http://www.ia.uned.es/~ejcarmona/DRIONS-DB.html
v takovem pripade je pro bezproblemovou funkci programu nutne z vybrane stazene databaze extrahovat slozku s nazvem images
a umistit do ni slozku s referencnimi konturami - umisteny ve slozce Reference.
Slozku s nazvem OD contour z patricne slozky s referencemi (HRF, DRIONS) je pak nutne vlozit do odpovidajici extrahovane slozky images se stazenymi obrazy.
Pri dodrzeni techto pravidel bude program fungovat opet automaticky, pouze bude nutne pri nacitani obrazu vyhledat slozku s obrazy (neotevre se primo cesta ke slozce)
Algoritmus je samozrejme schopen fungovat i bez techto opatreni, jen nebude dostupna volba vyhodnoceni presnosti pomoci referencnich kontur (pripadne bude nutne vybirat soubory s konturami rucne).
