
%% Nastavení jazyka při sazbě.
% Pro sazbu češtiny je použit mezinárodní balíček 'babel', použití
% národního balíčku 'czech', ve spojení s programy 'cslatex' a
% 'pdfcslatex' není od verze 3.0 podporován a nedoporučujeme ho.
\usepackage[
%%Nastavení balíčku babel (!!! pri zmene jazyka je potreba zkompilovat dvakrat !!!)
  main=czech,english       % originální jazyk je čeština (výchozí), překlad je anglicky
  %main=slovak,english      % originální jazyk je slovenčina, překlad je anglicky
%  main=english,czech       % originální jazyk je angličtina, překlad je česky
]{babel}    					% Balíček pro sazbu různojazyčných dokumentů; kompilovat (pdf)latexem!

\usepackage{lmodern}	% vektorové fonty Latin Modern, nástupce půvoních Knuthových Computern Modern fontů
\usepackage{textcomp} % Dodatečné symboly
\usepackage[LGR,T1]{fontenc}  % Kódování fontu -- mj. kvůli správným vzorům pro dělení slov
\usepackage{amsmath}
\usepackage{colortbl}
\usepackage[export]{adjustbox}
%\usepackage[table]{xcolor}
\usepackage{xcolor}
\usepackage{booktabs}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{caption}
\usepackage{threeparttable}
\usepackage{tabularx}
\definecolor{lightgray}{gray}{0.9}

\usepackage[
%% Z následujících voleb lze použít pouze jednu
  % semestral,					%	sazba zprávy semestrálního projektu (nesází se abstrakty, prohlášení, poděkování)
  %bachelor,					%	sazba bakalářské práce
  diploma,						% 	sazba diplomové práce
  %treatise,          % sazba pojednání o dizertační práci
  %phd,               % sazba dizertační práce
%% Z následujících voleb lze použít pouze jednu
% left,               % Rovnice a popisky plovoucich objektů budou %zarovnány vlevo
  center,             % Rovnice a popisky plovoucich objektů budou zarovnány na střed (vychozi)
]{thesis}   % Balíček pro sazbu studentských prací
                      % Musí být vložen až jako poslední, aby
                      % ostatní balíčky nepřepisovaly jeho příkazy



\newcommand{\zaverecnaprace}{diplomová\space}
\newcommand{\zaverecnepraci}{diplomové\space}
\newcommand{\Zaverecnaprace}{Diplomová\space}

\newcommand{\patchsize}{(48, 48, 48)}
\newcommand{\batchsize}{10\space}
\newcommand{\datasetimagesize}{(48,240,240)\space}
\newcommand{\slidingwindowstride}{(12,15,15)\space}

%% Jméno a příjmení autora ve tvaru
%  [tituly před jménem]{Křestní}{Příjmení}[tituly za jménem]
\autor[Bc.]{Tomáš}{Slunský}


%% Pohlaví autora/autorky
% Číselná hodnota: 1...žena, 0...muž
\autorpohlavi{0}

%% Jméno a příjmení vedoucího/školitele včetně titulů
%  [tituly před jménem]{Křestní}{Příjmení}[tituly za jménem]
% Pokud osoba nemá titul za jménem, smažte celý řetězec '[...]'
\vedouci[Ing.]{Martin}{Kolařík}

%% Jméno a příjmení oponenta včetně titulů
%  [tituly před jménem]{Křestní}{Příjmení}[tituly za jménem]
% Pokud nemá titul za jménem, smažte celý řetězec '[...]'
% Uplatní se pouze v prezentaci k obhajobě;
% v případě, že nechcete, aby se na titulním snímku prezentace zobrazoval oponent, pouze příkaz zakomentujte;
% u obhajoby semestrální práce se oponent nezobrazuje
\oponent[doc.\ Mgr.]{Křestní}{Příjmení}[Ph.D.]

%% Název práce:
%  První parametr je název v originálním jazyce,
%  druhý je překlad v angličtině nebo češtině (pokud je originální jazyk angličtina)
\nazev{Vícetřídá segmentace 3D lékařských dat pomocí hlubokého učení}{Multiclass segmentation of 3D medical data with deep learning}

%% Označení oboru studia
% První parametr je obor v originálním jazyce,
% druhý parametr je překlad v angličtině nebo češtině
\oborstudia{Teleinformatika}{Teleinformatics}

%% Označení ústavu
% První parametr je název ústavu v originálním jazyce,
% druhý parametr je překlad v angličtině nebo češtině
%\ustav{Ústav automatizace a měřicí techniky}{Department of Control and Instrumentation}
%\ustav{Ústav biomedicínského inženýrství}{Department of Biomedical Engineering}
%\ustav{Ústav elektroenergetiky}{Department of Electrical Power Engineering}
%\ustav{Ústav elektrotechnologie}{Department of Electrical and Electronic Technology}
%\ustav{Ústav fyziky}{Department of Physics}
%\ustav{Ústav jazyků}{Department of Foreign Languages}
%\ustav{Ústav matematiky}{Department of Mathematics}
%\ustav{Ústav mikroelektroniky}{Department of Microelectronics}
%\ustav{Ústav radioelektroniky}{Department of Radio Electronics}
%\ustav{Ústav teoretické a experimentální elektrotechniky}{Department of Theoretical and Experimental Electrical Engineering}
\ustav{Ústav telekomunikací}{Department of Telecommunications}
%\ustav{Ústav výkonové elektrotechniky a elektroniky}{Department of Power Electrical and Electronic Engineering}

%% Označení fakulty
% První parametr je název fakulty v originálním jazyce,
% druhý parametr je překlad v angličtině nebo v češtině
%\fakulta{Fakulta architektury}{Faculty of Architecture}
\fakulta{Fakulta elektrotechniky a~komunikačních technologií}{Faculty of Electrical Engineering and~Communication}
%\fakulta{Fakulta chemická}{Faculty of Chemistry}
%\fakulta{Fakulta informačních technologií}{Faculty of Information Technology}
%\fakulta{Fakulta podnikatelská}{Faculty of Business and Management}
%\fakulta{Fakulta stavební}{Faculty of Civil Engineering}
%\fakulta{Fakulta strojního inženýrství}{Faculty of Mechanical Engineering}
%\fakulta{Fakulta výtvarných umění}{Faculty of Fine Arts}

\logofakulta[loga/FEKT_zkratka_barevne_PANTONE_CZ]{loga/UTKO_color_PANTONE_CZ}


%% Rok obhajoby
\rok{Rok}
\datum{18.\,12.\,2018} % Datum se uplatní pouze v prezentaci k obhajobě

%% Místo obhajoby
% Na titulních stránkách bude automaticky vysázeno VELKÝMI písmeny
\misto{Brno}

%% Abstrakt

%Abstrakt podle normy [2] „má být tak informativní, jak to dovoluje podstata
%dokumentu, aby se čtenáři mohli na jeho základě rozhodnout, zda potřebují číst
%celý dokument. Vyjadřuje cíle, metody, výsledky a závěry obsažené v originálním
%dokumentu . . . Rozsah 250 až 500 slov.“

%Klíčová slova se uvádí v jednotném čísle a vystihují řešenou problematiku. Uveďte
%minimálně 5 klíčových slov. Klíčová slova seřaďte abecedně.




\abstrakt{%
%Diplomová práce se zabývá segmentací obrazu do více tříd pomocí konvolučních neuronových  sítí.
%Teoretická část práce se zaměřuje na souhrn problematiky segmentace obrazu, kde jsou popsány základní principy fungování jak samotných neuronových sítí, tak segmentací obrazu včetně popsání jejich různých typů a variant.
%V praktické částí je vybrána a podrobněji popsána metoda segmentace obrazu, která byla aplikována na dataset medicínských dat. Data jsou dodávána jako 3D skeny spolu s manuální vícetřídou segmentací. Dále je tu popsán postup zpracování trojrozměrných  dat a metody, jakými byla zefektivněna celá vícetřídá segmentace a trénování pomocí neuronové konvoluční sítě.
%Závěr práce vyhodnocuje dosažené výsledky a zasazuje je do širšího kontextu.


Diplomová práce se zabývá segmentací obrazu do více tříd pomocí konvolučních neuronových  sítí.
Teoretická část práce se zaměřuje na souhrn problematiky segmentace obrazu, kde jsou popsány základní principy fungování jak samotných neuronových sítí, tak segmentací obrazu včetně popsání jejich různých typů a variant.
V praktické částí je zvolena pro segmentace obrazu a podrobněji popsána architektura U-net, která byla aplikována na dataset medicínských dat.  Dále je tu popsán postup zpracování trojrozměrných  dat, jejich předzpracování a metody, jakými byla provedena celá vícetřídá segmentace.
Závěr práce vyhodnocuje dosažené výsledky a zasazuje je do širšího kontextu.

}{%
Master's thesis deals with multiclass image segmentation using convolutional neural networks.
The theoretical part of the Master's thesis focuses on image segmentation. There are basics principles of neural networks and image segmentation with   more types of approaches. In practical part the Unet architecture   is choosen and is  described  for image segmentation more. U-net was applied for medicine dataset. There is processing procedure which is more described for image proccesing of three-dimmensional data. There are also methods for data preproccessing which were applied for image multiclass segmentation.
Final part of current master's thesis evaluates results.
}

%% Klíčová slova
\klicovaslova{%
hluboké učení, konvoluční neuronové sítě, segmentace obrazu, strojové učení, neuronová síť,  umělá inteligence, vícetřídá segmentace obrazu
}{%
deep learning, convolutional neural networks, image segmentation, machine learning, neural network, artificial intelligence, multi-class image segmentation
}

%% Poděkování
\podekovanitext{%
Rád bych touto cestou poděkoval svému vedoucímu diplomové práce panu Ing.~Martinu Kolaříkovi za odborné vedení, konzultace, trpělivost a podnětné návrhy k~práci.
}%

% Zrušení sazby poděkování projektu SIX, pokud není nutné
%\renewcommand\vytvorpodekovaniSIX\relax