VAŠÍŘOVÁ, K. Evoluční inženýrství cyanobakterií v kontextu akumulace PHA [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2021.
Předložená práce se zabývá experimentálně náročnou a velmi aktuální oblastí směřující k mikrobiologickým a biotechnologickým aplikacím. Cílem experimentálního snažení je aplikace adaptivní evoluce na vybrané cyanobakteriální kmeny a následné studium změn (akumulace) polyhydroxyalkanoatů (PHA) v buňkách. Jako kandidáti pro evoluční inženýrství byly vybrány cyanobakteriální kmeny Synechocystis sp. PCC 6803 a Synechocystis salina CCALA 192, které byly podrobeny selekčním tlakům za přítomnosti mědi a peroxidu vodíku. Velkým přínosem jsou výsledky (akumulace PHA) vyhodnocené pomocí plynové chromatografie. Experimenty byly také prováděny na adaptovaných kmenech na NaCl. Byly použity kultury ze spolupracujícího mezinárodního pracovistě - Universität für Bodenkultur – BOKU. Kultury byly adaptované na roztok 6 % NaCl. Před započetím experimentů evolučního inženýrství bylo nutné experimentálně optimalizovat podmínky růstu - typ a objem media. Diplomantka samostatně a velmi pozorně nastudoval aktuální literaturu (práce obsahuje 127 referencí, což velmi oceňuji) . Precizně zvládla teoretickou část a i experimentální část. Jako velmi zdařilou hodnotím kapitolu 2 (Teoretická část) věnovanou velmi čtivému popisu vlastností cyanobakterie, PHA a v neposlední řadě evolučnímu inženýrství. . V práci je rutinně použito velké množství různých experimentálních technik sloužících pro monitoring stresu, stanovení biomasy, stanovení obsahu PHB v biomase, cytometrie a UV-VIS spektroskopie. Což svědčí o schopnosti diplomantky využívat snad všechny experimentální techniky dostupné v mikrobiologické laboratoři, které mohou pomoci ke splnění daných cílů a charakterizaci zkoumaných buněk. Velké množství experimentálních výsledků v této oblasti je třeba brát jako výrazný tvůrčí příspěvek k dalšímu pokroku v oblasti evolučního inženýrství. Vybrané výsledky presentované v práci by mohly sloužit jako základ publikace v odborném vědeckém časopise nebo presentaci na konferenci. Je zřejmé, že při řešení tématu diplomantka získala potřebné teoretické a experimentální znalosti k dalšímu rozvoji tohoto náročného výzkumu. Z prezentace získaných výsledků je vidět, že studentka je schopná samostatně řešit experimentální a teoretické problémy. Diplomantka se svého úkolu zhostila se ctí a na výborné úrovní, a proto tuto práci hodnotím klasifikačním stupněm A-výborně.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | A | ||
| Využití poznatků z literatury | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | B | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | A | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | A |
Bc. Kristýna Vašířová se ve své diplomové práci zabývá evolučním inženýrstvím cyanobakterií v kontextu akumulace PHA. V této práci byly využity dva kmeny cyanobakterií, konkrétně Synechocystis sp. PCC 6803 a Synechocystis salina CCALA 192, jak studentka uvádí kultivační dobu těchto kultur okolo 30 dnů. I výběr inovativních selekčních tlaků v rámci experimentů adaptivní laboratorní evoluce (peroxid vodíku a měďnaté ionty) nikterak neulehčil několikero uzavření laboratoří z důvodu pandemie. Proto hned ze začátku konstatuji, že i přes veškeré experimentální obtíže se studentka zhostila svého úkolu na výbornou. Autorka poskytuje v rámci kapitol Úvod a Teoretická část dostatečný a logicky uspořádaný obsahový základ k porozumění dané problematiky, kde využívá značné množství zahraničních zdrojů. Dále nás studentka postupně provází experimentální částí, kdy diskutuje jak pozitivní, tak negativní výsledky své práce. V této části bych kladně hodnotila především přístup k vyhodnocení dat a diskusi, kdy se studentka pokouší o propojení výsledků se současnými studiemi a zároveň výběru inovativních selekčních tlaků inspirovaných na základě literární rešerše. Nicméně v této části práci chyběly informace z hlediska věcného obsahu práce, a proto budou součástí otázek. Z formálního hlediska nemám skoro žádné připomínky, jelikož se v práci vyskytuje minimální počet překlepů či chybějících písmen až na doporučení nastavení stejných x a y os u cytogramů na str. 27 a 28. Ze stylistického hlediska byl velmi úsměvný pojem stanoviště a mráz. Závěrem bych chtěla konstatovat, že diplomová práce Bc. Kristýny Vašířové představuje kvalitní práci a poskytuje důležité informace pro navazující studium v oblasti evolučního inženýrství cyanobakterií v kontextu akumulace PHA. S ohledem na výše uvedené komentáře doporučuji práci k obhajobě a hodnotím stupněm A.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Logické členění práce | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | B | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Využití literatury a její citace | A | ||
| Úroveň jazykového zpracování | A | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | B |
eVSKP id 131516