ČAKAJDOVÁ, M. Analýza mikroflóry v sýrech pomocí DGGE [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2015.
Předložená diplomová práce se zabývá problematikou analýzy mikroflóry v sýrech pomocí metody denaturační gradientové elektroforézy (DGGE). Autorka přistupovala k řešení velmi iniciativně a aktivně. V průběhu řešení pracovala samostatně a systematicky. Zvládla celou řadu mikrobiologických a molekulárně genetických metod. V rámci mimořádně náročné experimentální části optimalizovala metodu PCR-DGGE pro analýzu komplexních vzorků sýrů a syrných nálevů, provedla reamplifikaci produktu PCR-DGGE a připravila vzorky pro sekvenční analýzu. Porovnala možnosti identifikace mikroorganismů pomocí metody DGGE, PCR-HRM a sekvenční analýzy. Velmi oceňuji také vypracování tvz. In silico, neboli bioinformatické analýzy získaných výsledků a interpretaci těchto dat. Celkově studentka prokázala schopnost samostatného řešení experimentálních problémů včetně kritického hodnocení výsledků. Výsledky a optimalizované metody získané v průběhu řešení diplomové práce jsou originální a představují cennou experimentální základnu pro navazující práce. Výsledky byly prezentovány na několika národních i mezinárodních konferencích a ve formě odborného článku také publikovány v časopise Mlékařské listy. Vzhledem k výše uvedeným skutečnostem hodnotím aktivity diplomantky stupněm výborně (A) a práci doporučuji k obhajobě.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | A | ||
| Využití poznatků z literatury | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | A | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | A |
Práce byla zaměřena na analýzu mikroflóry v kontrolních a kontaminových nezrajících sýrech a lácích. Studentka během jejího vypracování zvládla řadu molekulárně diagnostických technik – izolace DNA, její amplifikace s použitím primerů s GC svorkou, jejich následnou separaci pomocí denaturační gradientové gelové elektroforézy (DGGE). Dále byla DNA použita pro PCR v reálném čase s analýzou křivek tání amplikonů s vysokým rozlišením Amplikony byly rovněž sekvenovány a pomocí in silico analýzy bylo zjištováno pro které mikroorganismy jsou sekvence specifické. Práce byla proto experimentálně velmi náročná. Výsledky jsou odpovídajícím způsobem interpretovány. Získané poznatky jsou původní a výsledky byly publikovány ve dvou plakátových sděleních a v odborném časopise. Proto považuji práci za nadstardní. K práci nemám formální připomínky.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Logické členění práce | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | A | ||
| Využití literatury a její citace | A | ||
| Úroveň jazykového zpracování | A | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A |
eVSKP id 77244