SEDLÁŘ, K. Komprese genomických signálů pro klasifikaci a identifikaci organismů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.
Student Karel Sedlář se ve své diplomové práci zabýval zcela novou problematikou identifikace organismů na základě komprimovaných průběhů celogenomových genomických signálů. Provedl rozsáhlou literární rešerši, která v této multioborové problematice přehledně shrnuje jak biologickou část pojednávající o specifikách celogenomových sekvencích, tak bioinfomatickou část popisující transverzi genetické informace na signálovou a nakonec i část komprese číslicových signálů. Navrhl přístup ke snížení dimenze celogenomových signálů pro různé typy organismů, tak aby zůstala zachována specifičnost pro odlišné taxonomické skupiny a celý přístup ověřil na velkém množství celogenomových záznamů z veřejných databází. Práce je po formální i odborné stránce na velmi dobré úrovni. Celkově hodnotím práci 100 body a stupněm A.
Student nastudoval problematiku transformace symbolického zápisu DNA na genomický signál a řádně ji v práci popsal. Dále nastudoval a popsal teorii komprese dat, včetně algoritmů používaných ke kompresi symbolického zápisu DNA. Rozebral a úspěšně realizoval kompresi genomických signálů s využitím vlnkové transformace. V poslední části práce úspěšně klasifikoval eukaryotické i prokariotické organismy. Po formální stránce je práce na vynikající úrovni. Po odborné stránce student prokázal, že se orientuje v problematice klasifikace genomických signálů, k čemuž využil celou řadu pokročilých metod, jako je shluková analýza, dynamické borcení časové osy, nebo vlnková transformace. Vzhledem k rozsahu práce a jejímu zpracování práci hodnotím plným počtem bodů.
eVSKP id 65505