PŘIBYL, J. Vizualizace a export výstupů funkční magnetické rezonance [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2015.
Předložená práce se skládá ze dvou hlavních částí. První polovina je věnována úvodu čtenáře do problematiky měření a zpracování dat funkční magnetické rezonance. Studentovi se podařilo v poměrně náročné problematice zorientovat a popsat jak princip metody, tak i podrobný postup práce s daty. Na konci první části jsou zmíněny často užívané softwarové balíky pro zpracování fMRI dat, na jejichž výstupy bude program navazovat. V druhé části práce je poté představen vytvořený program, který má za cíl usnadnit a zpřehlednit výzkumníkům práci s enormním množstvím dat, která v průběhu fMRI analýz vznikají. Student ověřil přínos programu na datech dvou klinických studií, která byla poskytnuta pracovníky vědeckého centra CEITEC. Text práce obsahuje drobné nedostatky odborného rázu, zejména v teoretické části, dále potom několik stylistických chyb a překlepů. Zmíněné nedostatky však nesnižují kvalitu práce. Student pracoval účinně a metodicky po celou dobu semestru. Krom doporučené literatury si obstaral mnoho dalších pramenů, ze kterých čerpal při tvorbě své práce. Program vytvořený v rámci diplomové práce vyžaduje prostředí MATLAB a zahrnuje uživatelsky přívětivé grafické rozhraní. Zdrojový kód programu je dobře strukturovaný a funkční, avšak na několika místech postrádá vhodný komentář. Při tvorbě programu student často využíval konzultací. Práce splňuje zadání ve všech bodech a proto ji hodnotím známkou výborně (93 bodů).
Student se v úvodní teoretické části práce zabývá popisem principu měření pomocí magnetické rezonance, rešerší metod měření a analýzy dat funkční magnetické rezonance (fMRI). Detailněji se zabývá metodami, jejichž výstupy vizualizuje navrženým programem fMRIA. V této části jsou také popsány toolboxy (SPM, GIFT), které jsou programem využívány. Text v této části je logicky provázaný, za úvahu by stálo kapitolu o analýze nezávislých komponent předřadit před popis software pro analýzu fMRI dat. Občas (v přípustné míře) text obsahuje překlepy, špatné skloňování, nepřesnosti a nesrovnalosti. Například v kapitole 2.6.2 autor nesprávně uvádí, že nejčastější volená hodnota prahu významnosti při mnohonásobném testování u fMRI dat je p = 0.001 a v kapitole 2.6.3 toto tvrzení správně vyvrací; popis NIFTI formátu je v kapitole 5.2 a ne v 3.1 jak je odkazováno. Kladně hodnotím popis obecného lineárního modelu a především velmi dobře zpracované vysvětlení analýzy nezávislých komponent. Dále velmi kladně hodnotím část, věnující se srovnání existujících software pro analýzu fMRI dat a například uvedené praktické poznámky ohledně náročnosti programu na operační paměť. Druhá část práce je praktická a věnuje se popisu programu a jeho využití. Logický a výstižný popis programu je doplněn přehlednými vývojovými diagramy a obrázky. Prezentovaný kód programu je rovněž strukturovaný, přehledný, okomentovaný a lze se v něm dobře orientovat. Student také program otestoval na datech ze dvou studií. Na závěr je práce přehledně shrnuta a diskutována. Program využívá správné postupy, je plně použitelný, intuitivní, v práci je vhodně prezentován a splňuje všechny požadavky zadání práce. Program umožňuje výzkumníkům urychlit a zjednodušit práci při studiích využívajících analýzu nezávislých komponent. Formální stránka práce je celkově na velmi dobré úrovni. Text na sebe logicky navazuje a je (až na výjimky) napsán tak, aby mu rozuměl i člověk, který se nespecializuje na fMRI tématiku. Text i obrázky jsou dobře popsány a citovány, zde bych vytknul jen chybějící citace u některých rovnic. Student kompletně splnil zadání práce, nad rámec zadání vytvořil manuál k programu v českém i anglickém jazyce. Vyskytující se chyby jsou spíše formálního než odborného charakteru, proto navrhuji hodnocení stupněm B 87 b.
eVSKP id 84440