classify_wsi_test - slouží pro otestování klasifikace snímku do tříd zdravý / nadorový

convert_mask - skript, který převadí tiff soubory masek do souborů kompatibilních s openslide

convert_wsi - to samé co convert_mask ale pro snímky tkáně

create_tissue_mask - soubor pro vytvoření masky celé tkáně pro WSI snímek v nižším rozlišení

gt_lowres - vytváří masku nádoru v nižším rozlišení

healthy_tissue_mask - pro vytvoření masky zdravé tkáně nádorových snímků (nižší rozlišení)

model - je zde definován základní U-Net který byl využit v práci

normal_tissue_mask - vytvoření masek zdravých snímků WSI v nižším rozlišení