BLAŇKA, O. Využití mikroskopie atomárních sil při morfologické a fyzikálně-chemické analýze mikrobiálních buněk a buněčných komponent [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2023.

Posudek vedoucího

Slaninová, Eva

Ondřej Blaňka se ve své bakalářské práci věnoval tématu využití mikroskopie atomárních sil při morfologické a fyzikálně-chemické analýze mikrobiálních buněk a buněčných komponent. Cílem práce bylo prostudování mechanicko-morfologických vlastností mikroorganismů produkující polyhydroxyalkanoáty (PHA) a mikroorganismů, které nejsou schopny produkce těchto metabolitů. Dále byly rovněž charakterizovány buněčné komponenty, konkrétně izolované intracelulární granule PHA v jejich nativní formě. V poslední části této práce se podařilo studentovi vůbec poprvé charakterizovat Youngův modul celých buněk, jejich částí a nativních PHA granulí v kapalném prostředí pomocí mikroskopu atomárních sil a to díky inovativnímu přístupu vyhodnocování naměřených dat. Dále musím studenta velmi pochválit s jakou pečlivostí, zodpovědností a velkou mírou samostatnosti se zhostil, jak zaučení v rámci kultivačních postupů, ale i osvojení dovedností potřebných k měření na mikroskopu atomárních sil (příprava vzorků, nastavení přístroje aj.). Také bych chtěla vyzdvihnout s jakou trpělivostí Ondřej Blaňka pracoval i přes vyšší časové nároky, než jsou u bakalářských prací běžné. I přes trochu problémové vypracování a odevzdávání textové části bakalářské práce, vypracoval student odborný text splňující dané požadavky závěrečných prací. Na základě výše uvedeného doporučuji práci k obhajobě a hodnotím ji známkou A.

Posudek oponenta

Smilek, Jiří

Bakalářská práce studenta Ondřeje Blaňky je tematicky zaměřena na využití mikroskopie atomárních sil (AFM) ve studiu buněk a buněčných komponent. AFM je v tomto kontextu využíváno jak k zobrazování buněk v jejich nativních stavu, tak také v módu silové spektroskopie ke studiu mechanických vlastností na lokální úrovni. Nutno podotknout, že téma je vysoce aktuální a progresivní. Neexistuje spoustu technik, které by byly pro účely studia buněk v jejich nativním stavu využitelné. Proto si jakožto oponent velmi cením tohoto tématu. Práce je standardně členěna na teoretickou část, kde autor poměrně obstojně uvádí čtenáře do problematiky modelových mikroorganismů, PHA a zároveň také zmiňuje základní principy mikroskopie atomárních sil. K logickému členění práce nemám žádných výhrad a hodnotím jej stupněm „A – výborně“. Snad jen pro pobavení čtenářů posudku, a i samotného autora práce si neodpustím poznámku o chybějící stránce českého abstraktu v tištěné verzi. Při otevření práce jsem byl nadšen, když jsem prvně uviděl anglicky psaný abstrakt a v duchu jsem chválil autora za to, že píše práci v angličtině. Abych vzápětí byl zklamán, když jsem zjistil, že česky psaný abstrakt v tištěné verzi chybí. Splnění požadavků zadání, tj. splnění definovaných cílů práce hodnotím stupněm „B – velmi dobře“. Dle mého názoru byly téměř všechny cíle naplněny. Trochu hapruje splnění cíle 5). Diskuze využitelnosti AFM pro studium buněčných organismů a komponent dle mého názoru není úplně dotažena do konce. Využití literatury a její citace hodnotím taktéž stupněm „B – velmi dobře“. V práci postrádám studium současného stavu řešené problematiky v „klasickém formátu“. Toto by se dalo autorovi odpustit, pokud by rešerše k zadané problematice byla rozptýlena v teoretické části. To bylo naplněno pouze částečně. Nalezl jsem pouze 4 odborné zdroje, ke kterým komentáře alespoň částečně splňují charakter rešerše. Úroveň jazykového zpracování práce hodnotím stupněm „C – dobře“. V práci se vyskytuje několik překlepů, jazykových nedokonalostí a typografických nedostatků. Bohužel to snižuje kvalitu jinak velmi dobré závěrečné práce. Zde několik konkrétních poznatků: str. 8 „hlavě“ místo „hlavně“, str. 17 „elektromagnetických sil“ namísto „elektrostatických sil“, na str. 21 je uveden vzorec chlormethanu, zatímco v práci byl při přípravě vzorků používán chloroform, str. 25 „místění laseru“ namísto „umístění laseru“. Z výše uvedeného také plyne hodnocení formální úrovně práce: „B – velmi dobře“. Kvalita zpracování výsledků stejně jako jejich interpretace a diskuze je na poměrně dobré úrovni a hodnotím ji stupněm „B – velmi dobře“. V některých případech je ovšem jejich zpracování poněkud kostrbaté a nedotažené. Nebudu zmiňovat konkrétní záležitosti, na tuto problematiku navazují otázky oponenta. V diskuzi se student mnohdy omezuje pouze na konstatování faktů a popisu grafických záležitostí, aniž by hledal mezi výsledky jakoukoliv provázanost. Ono se to dá respektovat, vzhledem k tomu, že se jedná o studentu první práci podobného charakteru. Pevně věřím, že v navazující VŠKP již bude diskuze kvalitnější. Celkově považuji práci Ondřeje Blaňky za poměrně kvalitní dílo, za které se rozhodně nemusí stydět. Práce obsahuje velké množství kvalitních dat (především z pohledu lokálních mechanických vlastností buněk), na kterých se dá stavět další bádání. Práci Ondřeje Blaňky hodnotím stupněm „B – velmi dobře“ a doporučuji ji k obhajobě.

eVSKP id 148952