KUPKOVÁ, K. Bioinformatika lidského genomu [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2011.
Teoretická část předložené práce je na vysoké odborné i formální úrovni. Pečlivě zpracovaný text obsahuje klíčové informace o DNA a lidském genomu v zhuštěné formě ale srozumitelně. Výskyt chyb je v textu ojedinělý. Vytvořená uživatelská aplikace umožňuje zpracovat fasta soubory DNA sekvencí stažených z databází. Program je funkční, pouze není ošetřeno storno uložení nalezeného úseku opakování adeninu a guaninu v sekvenci. Studentka provedla analýzu vybraných genů z jednoho chromozomu člověka a šimpanze. Výsledky jsou správně interpretovány. Citace literatury je korektní a více než dostatečná.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Využití literatury | A | 10/10 | |
| Formální zpracování práce | A | 20/20 | |
| Aktivita během řešení a zpracování práce (práce s literaturou, využívání konzultací, atd.) | A | 19/20 | |
| Splnění zadání | A | 46/50 |
Studentka Karolína Lankašová se věnovala problematice vyhodnocení obsahu genomu se zaměřením na oblasti bohaté na guanin a adenin. Teoretická část práce (kapitola 1) obsahující rozbor problematiky z pohledu molekulární biologie a genetiky má rozsah pouhých 12 stran. Lze to však akceptovat, protože kapitola obsahuje pouze relevantní a přesné informace. Výjimku tvoří podkapitola 1.6 nazvaná Matlab. Text v rozsahu 2 odstavců je zde zařazen zcela nesmyslně. Praktická část (kapitola 2) obsahuje popis vlastní tvorby autorky a je popsána na pouhých 10 stranách. Bohužel vše začíná popisem programu, který je však jen realizací metody zpracování dat. Vlastní metodu a její detaily je nutné doslova vypreparovat z následujícího textu, ve kterém je současně zahrnut popis výsledků. Vlastnosti metody jsou diskutovány opět velmi stručně v jediném odstavci na str. 33. Například v zadání požadované zhodnocení konzervovanosti úseků z adeninem a guaninem se omezuje na konstatování: "Z podobnosti úseků je patrné, že úseky mají v genu podstatnou funkci a jsou v evoluci konzervovány.". Pro takové tvrzení však chybí důkaz, neboť podobnost není kvantifikována a jde zřejmě jen o vizuální hodnocení. Přes uvedené výtky má však práce svoji hodnotu, kterou vyjadřuji známkou C a doporučuji k obhajobě.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | B | 17/20 | |
| Odborná úroveň práce | C | 39/50 | |
| Interpretace výsledků a jejich diskuse | D | 13/20 | |
| Formální zpracování práce | B | 8/10 |
eVSKP id 39554