POŠUSTOVÁ, V. Studium migrace mesenchymálních kmenových buněk na principu chemotaxe [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2020.
V diplomové práci se studentka zabývala in vitro metodami hodnocení migrace buněk na principu chemotaxe. V teoretické části práce jsou popsané tyto metody se zaměřením na sledování mesenchymálních kmenových buněk. V praktické části si studentka osvojila práci v buněčné laboratoři a ověřila dvě metody pro hodnocení migrace buněk. Pro hodnocení dat nasnímaných pomoci fluorescenčního konfokálního mikroskopu aplikovala metody zpracování obrazů. Dosažené výsledky a vzniklé problémy jsou vhodně diskutovány. Po formální a odborné stránce je práce na velmi dobré úrovni. Řazení kapitol je přehledné, použitá literatura je vhodně citovaná. Přesto vytýkám seřazení literatury, které není podle výskytu v textu. Studentka vhodně využívala konzultačních hodin, pravidelně docházela na laboratorní experimenty a prokázala schopnost samostatné práce. Rozpracovaná verze práce byla odevzdána v termínu. Zadání diplomové práce považuji za splněné. Práci doporučuji k obhajobě a hodnotím stupněm A (95 bodů).
Diplomová práce řeší velmi aktuální problematiku buněčné biologie a regenerační medicíny, kterou je efektivní monitoring migrační schopnosti buněk pacientů. Cíle zadání byly splněny. Rozsah práce i logické navaznosti textu jsou velmi dobré, výborná je jazykový a formální úprava. Studentka také velice efektivně pracovala s dostupnou literaturou na dané téma. Velmi dobře jsou popsány i metodiky a výsledky, v některých kapitolách popisujících zpracování obrazu by však bylo vhodné uvést více ilustračních příkladů konkrétních obrazů. Prací se však line sada odborných nepřesností a popisných nedokonalostí: Problém 1 = Ne zcela štastná je logika citování originálních prací jiných autorů, nevím zda studenti v semináři k DP byli seznámeni se škálou variant vložení citací, neexistuje totiž jen jedna varianta, kdy publikace (tedy hranatá závorka s číslem) je až na konci věty nebo souvětí. Když je srovnávano cokoli z několika prací v jedné větě, je zcela logické použít i jméno hlavního autora nebo studie (respektive hranaté závorky) uprostřed věty a nejen jako apendix za větou. Například zahajuje se v teoretické části několikrát popis typu: "V této poměrně nové studii.." ale samotná studie VASATURO 2012 je uvedena nelogicky až o 3 věty dále na úplném na konci odstavce. Problém 2 = Nepřesné a hovorové termíny a věty pro danou tématiku, například: „MSC izolované z adipocytů“ (správně z adipozní tkáně, nikoli transformace z jiného typu buněk) „seškrábnutí vrchní strany membrány“ (asi myšlena vrstva buněk na svrchní straně) Problém 3 = Zavádějící popis fyzikálních a biofyzikálních jevů a veličin (zhruba 10x) str12 "gradient vzniká, díky působení difúzní síly přes porézní membránu." (ale tyto síly právě vyrovnávají delta C, čili eliminují gradient) str12 "stanoven gradient difúze" (myšleno asi dle kontextu spíše gradient koncentrace dané chemické složky, nikoli nějakého fyzikálního jevu difuze) str47 “Nepoužije k tomu však jen jeden pór, protože gradient chemoatraktantu je vytvořen všude stejný” (neprokázaná implikace) str 23 "Pokud určité molekule, zpravidla elektronu, dodáváme energii..." (čtenář asi chápe, ale stylisticky chybné) V kapitole Závěr je na místě varovat před sklouznutím k "populárně naučnému textu" a nepřesnému vyvozování něčeho co citované publikace úplně nedokazují, například věta "Aby buňka migrovala celá včetně jádra, musí vykonat aktivní pohyb přes membránu, který se jí vyplatí pouze tehdy, pokud migruje do výhodnějšího prostředí." (pozor, MSC buňky v realitě totiž migrují například v rámci SDF-1 gradientu nebo hypoxického gradientu doslova do nebezpečného prostředí infarktu nebo zánětu a "opravují" zde ještě, co se dá, pak končí většinou po pár hodinách mrtvé) Otázka: 1/ Uvádíte, že "Pro účely této diplomové práce byla použita komerční varianta testu Corning® Transwell®-24 s membránou s póry o velikosti 8 m." Proč nakonec padla volba právě na tuto velikost poru? 2/ Jelikož není v teoretickém úvodu uplně bezesporně vysvětlena souvislot difuze, difuzní síly a gradientu koncentrace molekul v roztoku, můžete pro jisototu uvést ze základního kurzu fyziky první a druhý Fickův zákon ? Myslíte, že čistě teroeticky by tento zákon platil i pro "pasivní" pohyb takových objektů v in-vitro komůrce, jako jsou mrtvé bunky na jedné straně membrány (tj. buňky nevykazující vlastní motilitu)?
eVSKP id 126748