HANZLÍKOVÁ, A. Analýza inverzních repetic v genomu lidských patogenů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2020.
Ve své bakalářské práci se Anna Hanzlíková věnovala analýze inverzních repetic u lidských virových patogenů. Ve své práci studovala také aktuálně sekvenovaný genom viru SARS-cov2. Během studia se naučila hledat sekvenční data v genomové databázi a základní práci s in silico nástroji pro jejich analýzu. Bohužel nevyužila naplno potenciál zadaného tématu v předpokládaných termínech a její výsledky, i když nebylo nutné využití laboratoří, byly zpracovávány se zpožděním, tomu také odpovídá nižší kvalita jejich zpracování. Nicméně studentka získala cenné výsledky a zkušenosti, které ve své práci úspěšně prezentuje v dostatečné kvalitě pro bakalářskou práci. Bakalářskou práci vypracovala samostatně a získala originální výsledky, které ve své práci prezentuje a diskutuje. V porovnání s ostatními studenty byla její aktivita výrazně nižší, což odpovídá jejich prezentaci a práci hodnotím jako dobrou – C.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Kvalita zpracování výsledků | C | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Závěry práce a jejich formulace | B | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | C | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | C | ||
| Splnění požadavků zadání | B | ||
| Studium literatury a její zpracování | B | ||
| Využití poznatků z literatury | C |
Studentka Anna Hanzlíková se ve své bakalářské práci věnuje analýze inverzních repetic v genomu lidských patogenů. Téma práce je z mého pohledu velmi zajímavé a aktuální. Závěrečná práce je členěna na teoretickou část (14 stran), experimentální část (1,5 strany) a část věnující se výsledkům a jejich diskuzi (6 stran). V teoretické části práce se věnuje především patogenům, které po rozdělení následně dále charakterizuje, a také jednotlivým virům (SARS-CoV, SARS-CoV-2, HBV a HPV), které v experimentální části práce podrobuje bioinformatické analýze. Poslední část teorie se zabývá popisem softwaru Palindrom analyser. Z lokálních struktur DNA, jež mají být hlavní náplní rešerše, studentka charakterizuje pouze křížové struktury. Pro lepší orientaci především v teoretické části bych navrhovala poupravit strukturu jednotlivých kapitol za účelem lepší návaznosti textu a také zamezit duplicitním názvům kapitol v teoretické a výsledkové části. Pozitivně hodnotím množství a kvalitu použitých zdrojů informací. Experimentální část popisuje využití softwaru při vyhledávání a analýze inverzních repetic ve zkoumaném genomu, v rámci výsledků jsou pro výše uvedené viry na základě analýzy uvedeny a diskutovány počty a charakteristiky nalezených inverzních repetic. Postrádám např. porovnání vybraných genomů, je-li relevantní. Nejzajímavější výsledky byly shrnuty v závěru. Z hlediska jazykového zpracování mám výhrady především k teoretické části práce, kde jsou místy využívány doslovné překlady cizojazyčné literatury, které znesnadňují pochopení sdělované informace. I přes zmíněné připomínky byly definované cíle práce splněny, proto ji doporučuji k obhajobě a celkově ji hodnotím stupněm C. Některé připomínky: - Patogeny definujete jako organismy, ale viry ani priony mezi typické organismy nepatří. - Rody a čeledi kurzívou (př. Orthohepadnavirus, Bacillus, atp.) - Popisek obrázku 4 – životní cyklus viru SARS-CoV-2, nikoli onemocnění COVID-19 - Str. 18: Fulminantní nikoli fulminující - RT-PCR – zkratka pro polymerázovou řetězovou reakci využívající reverzní transkripci, v textu využívána správně, ve zkratkách definována jako polymerázová řetězová reakce v reálném čase
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Úroveň jazykového zpracování | C | ||
| Logické členění práce | C | ||
| Využití literatury a její citace | A | ||
| Splnění požadavků zadání | B | ||
| Závěry práce a jejich formulace | C | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | C | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Kvalita zpracování výsledků | C |
eVSKP id 124252