MONDEKOVÁ, V. Diagnostika genomem podmíněných onemocnění za využití mikro a nanočástic [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2011.

Posudek vedoucího

Provazník, Valentýna

Studentka Věra Mondeková přistupovala k plnění práce aktivně a zodpovědně. Práce si kladla za cíl využít magnetické částice ve spojení s elektrochemickými technikami k detekci virových sekvencí, což se podařilo. Studentka se naučila ovládat elektrochemický analyzátor a práci s magnetickými částicemi. Také se seznámila s informačními databázemi, jako nezbytný nástroj k určení správných sekvencí studovaných virů. Tato práce bude základem pro další výzkumné aktivity.

Posudek oponenta

Prášek, Jan

Předmětem bakalářské práce byla oblast detekce specifické sekvence virulentního patogenu pomocí biosenzoru. Dle zadání se měla studentka zaměřit na studium problematiky biosenzorů, nanočástic, vybraných elektrochemických metod a biokompatibilní molekuly vhodné k modifikaci povrchu nanočástic. Na základě získaných znalostí měla provést jejich výběr a navrhnout postup zachycení a monitorování virových patogenů pomocí nanobiosenzoru, který měla navrhnout a ověřit v základním experimentu. Úkol vyžadoval zpracování množství literatury z oblasti medicíny, bioanalýzy, magnetických nanočástic a elektrochemických metod pro stanovení látek rozpuštěných v roztocích se zaměřením na detekci nukleových kyselin. Zde studentka prokázala dostatečnou schopnost nalézt a použít odbornou literaturu a materiály týkající se dané problematiky. Jednotlivé části práce uspořádala v logickém sledu tak, že tvoří ucelený a souvislý pohled na řešení zadané problematiky. Oproti zadání, kde se hovořilo o nanobiosenzoru studentka v rámci práce vytvořila pouze biosondu, o které se však nedá hovořit jako o biosenzoru. Předpokládám, že k tomuto problému došlo pouze vlivem nepřesné komunikace mezi školitelem a odborným vedoucím na spolupracujícím pracovišti a proto zadání považuji za splněné s výhradou. Kvalita zpracování této bakalářské práce odpovídá požadovanému standardu. V úvodní části práce se studentka zabývá viry, jejich morfologií a chemickou strukturou, izolací a analýzou nukleových kyselin pomocí běžně používaných metod, speciálně pak pomocí elektrochemické analýzy. Dále se zabývá magnetickými nanočásticemi, jejich strukturou, syntézou a využitím, zejména pak jejich využitím v oblasti izolace nukleových kyselin. V praktické části práce se studentka zabývá návrhem biosondy s ohledem na její kompatibilitu s cílovou sekvencí včetně jejího ověření v databázi NCBI. V práci následuje elektrochemická detekce vzorků virových sekvencí pomocí rtuťové elektrody. V tomto místě postrádám návaznost na předchozí text, protože z něj není patrné, co přesně bylo se vzorky v daném okamžiku před zahájením elektrochemické analýzy provedeno. Dále studentka provedla optimalizaci teploty hybridizace a následně ověřila funkčnost izolace. Naměřené výsledky studentka zpracovala a přehledně vynesla do grafických závislostí a okomentovala. Formální zpracování diplomové práce je na dobré úrovni. Přesto se zde vyskytly drobné nedostatky, jako jsou například chybějící odkazy na obrázky v textu, chybějící jednotky u některých vzorců, popis tabulky pod tabulkou, chybějící legenda na obrázku 21, atp. Literatura není v textu řazena chronologicky a odkaz na pět uvedených literatur v textu chybí úplně. Seznam literatury nemá jednotnou formu. Navíc jsou některé části práce psány v první osobě, což se neslučuje s požadavky na psaní technických textů. Svými výsledky práce přispívá k řešení problematiky v oblasti spolehlivé izolace a detekce virů v medicíně a i přes výše uvedené nedostatky ji doporučuji k obhajobě a klasifikuji ji hodnocením C.

eVSKP id 39558