Aby bylo možné soubor spustit je potřeba mít na počítači naistalovaný Matlab compiler runtime (MCR) verze 7.14

Podrobnější popis funkce programu a jednotlivých jeho částí je možné najít v bakalářské práci.

Po spuštění programu se objeví hlavní okno aplikace na tvorbu bootstrapových konsenzuálních stromů.

1. Načtěte soubor se sekvencemi ve FASTA.

2. Vyberte informaci z hlavičky, která bude použita jako pojmenování sekvencí ve stromu

3. Případně toto pojmenování upravte, aby žádné dvě sekvence neměly stejný název!!!

4.Nastavte parametry rekonstrukce a spusťte.

5. Vyčkejte na vykreslení fylogramu v nezávislém okně. Proces může trvat několik minut!

6. Zavřete program tlačítkem ukončit