POLÁKOVÁ, V. Využití konvolučních neuronových sítí pro segmentaci chrupavčitých tkání myších embryí v mikro-CT datech [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2021.
Studentka po celou dobu přistupovala k řešení diplomové práce velmi aktivně a svědomitě, na konzultace byla vždy připravena a přicházela s konkrétními dotazy. Často navrhovala současně i možná řešení daných problémů. Prezentační úroveň práce je velmi vysoká. Kladně hodnotím zejména cílený popis dílčích částí bez zbytečného opakování obecně známých skutečností a metod, čímž je rozsah práce udržen na rozumné úrovni bez ztráty informační nosnosti. Struktura práce je logická, text vhodně navazuje a je velmi čtivý. Po formální stránce nemám žádné výhrady, naopak pozitivně hodnotím rozhodnutí psát práci v anglickém jazyce. Studentka používala velké množství relevantních, velmi aktuálních zahraničních zdrojů, které ve své práci vhodně citovala. Veškeré kroky provedené v praktické části jsou vždy logicky odůvodněny a následně i vhodně vyhodnoceny a diskutovány. Práce probíhala ve spolupráci s laboratořemi CEITEC VUT, přikládám proto také hodnocení konzultanta, který dále podtrhuje využitelnost studentkou dosažených výstupů: „Studentka se ve své práci zabývala využitím 3-D informace pro segmentaci chrupavčité tkáně v mikroCT snímcích myších embryí metodou hlubokého učení, což je vzhledem k velikosti dat nesnadný úkol. Výsledkem práce je metoda pro plně 3-D obrazovou segmentaci mikrotomografických dat, která byla optimalizována pro daný segmentační problém. Studentka na zadaném tématu pracovala svědomitě, práci pravidelně konzultovala a přicházela s vlastními návrhy pro možná zlepšení. Výsledky a poznatky získané při vypracování práce budou v laboratoři dále využívány a umožní nám dále pokročit v automatizaci obrazových analýz pro výzkum v oblasti vývojové biologie, který naše laboratoř provádí ve spolupráci se zahraničními partnery (Medical University Vienna, Institut Pasteur). Celkově hodnotím spolupráci studentky s naší laboratoří jako velice přínosnou.“ Z pozice vedoucího práce, a s přihlédnutím k výše zmíněnému, považuji všechny body zadání za splněné a práci tak hodnotím stupněm A (100 bodů).
Studentka se ve své práci zabývala využitím 3-D konvolučních sítí pro segmentaci chrupavčité tkáně myších embryí v mikro-CT datech. Formální úroveň práce je na výborné úrovni a studentka citovala a využila velké množství relevantních zdrojů. Teoretická část práce je popsána velmi kvalitně a zaměřuje se přesně na relevantní informace potřebné pro tuto práci. V praktické části studentka popisuje implementaci velmi pokročilé 3D segmentační neuronové sítě pro daný problém. Dále se studentka zaměřuje hlavně na využití několika prvků vylepšujících tuto neuronovou sít. Množství těchto otestovaný metod je velmi rozsáhlé, kde vše je vhodně vyhodnocené a diskutované. Velmi kladně hodnotím také výborné navázání práce na předchozí výzkum. Vytvořená metoda i přes velkou snahu studentky nedosahuje výsledků 2D segmentační sítě aplikované na jednotlivé řezy, to však nijak nesnižuje hodnotu popisovaných výsledků, ba naopak tento fakt přináší zajímavý závěr. Celkově je práce na vysoké úrovni. Hodnotím stupněm A - 100 bodů.
eVSKP id 134437