Parametry simulace nastavitelné v „simpar_kk.m“, který umožňuje nastavení základních parametrů:
•	teplota v Kelvinech,
•	jednodimenzionální nebo dvojdimenzionální simulace,
•	poloměr částice v mikronech,
•	časový krok v sekundách,
•	dobu simulace v sekundách,
•	počet simulovaných trajektorií,
•	přítomnost setrvačnosti,
•	přítomnost náhodné síly,
•	počáteční poziční parametry,
•	tuhost pasti.

Spouštění funkcí "simul".