KUBÁČKOVÁ, E. Molekulárně biologická charakterizace vybraných producentů PHA [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2020.
Ve své diplomové práci se Bc. Eliška Kubáčková věnovala molekulární charakterizaci PHA produkujících bakterií. V rámci své práce se jednak věnovala identifikaci a genotypové analýze schopnosti produkce PHA u termofilních izolátů a zároveň se v rámci své práce pokusila vyvinout metodiku pro studium exprese vybraných genů u bakterie Cupriavidus necator. Po delším adaptačním období se studentka teoreticky, prakticky i metodicky seznámila se studovanou problematikou a především v letním semestru přistupovala k řešení své práce aktivně a v rámci možností i samostatně. Brzy si osvojila řadu nerutinních laboratorních postupů a molekulárních technik. Při samotném vypracování textové části své diplomové práce prokázala solidní orientaci ve svěřené problematice a dokázala vypracovat kvalitní teoretickou část, stejně tak se jí podařilo zajímavě a čtivě zpracovat, komentovat a diskutovat experimentální výsledky. Proto celkově hodnotím práci a přístup studentky jako výborný a hodnotím ji známkou A.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | A | ||
| Využití poznatků z literatury | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Závěry práce a jejich formulace | B | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | A | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | B |
Předložená diplomová práce Bc. Eliška Kubáčkové „Molekulárně biologická charakterizace vybraných producentů PHA“ má rozsah 80 stran. Formální i obsahová úroveň práce je na dobré úrovni a práce vyváženým dojmem. Úvod je zpracován na 20 stranách a jsou v něm shrnuty informace o PHA se zaměřením na mikroorganismy produkující PHA. Studentka se věnovala zejména kultivaci producentů PHA a jejich charakterizaci pomocí PCR metod. Technicky by bylo vhodné pro přehlednost rozdělit „Experimentální část“ na „Materiál a metody“ a „Výsledky“. Kontrola čistoty DNA byla prováděna jen pomocí spektrometrie, v budoucnu bych doporučovat i použití gelové elektroforézy (na straně 47 se sice píše: „Úspěšná izolace bakteriální DNA byla ověřena elektroforézou na agarózovém gelu“, ale obrázek, stejně jako koncentrace získané DNA, chybí. Na straně 36 se mluví o multiplexní PCR, ale byly použity dvě sady primerů, tedy bylo by vhodnější použít termín duplexní PCR (podobně kapitola 3.8.2.). Chybí popis jednotlivých startů v legendě některých obrázků (Obr. 14, 17,18). Je také vhodné, aby označení startů u gelů nezasahovalo do obrázku gelu. Studentka zvládla celou řadu metodik včetně kvantitativní PCR, výsledky dobře zpracovala a demonstrovala tak své předpoklady pro úspěšnou odbornou práci a její diplomovou práci proto doporučuji k obhajobě. K práci mám následující dotazy: Na straně 35 je uvedeno, že „byla použita sada primerů na základě literatury“, citace ovšem chybí – jaká literatura byla využita? Proč byly vzorky označeny BŽ a FŇ? Bylo by vhodné vysvětlit a dát do seznamu zkratek. Na obrázku 25 nevidím u vzorků ani DNA ani RNA. Jaké byly nanášeny koncentrace? Na obrázku 25 je blíže startu uveden proužek o velikosti 551bp a dále ve velikosti 1500bp, nukleové kyseliny by ale měly putovat v gelu tím rychleji, čím jsou kratší – proč je takto označeno a nejedná se o chybu?
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Logické členění práce | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | C | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | A | ||
| Využití literatury a její citace | B | ||
| Úroveň jazykového zpracování | A | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A |
eVSKP id 122773