KOLÁČEK, J. Počítačové modelování difúzního transportu v hydrogelech [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2024.

Posudek vedoucího

Pekař, Miloslav

Jakub Koláček přistupoval k plnění zadání diplomové práce samostatně a iniciativně, pravidelně využíval konzultací k diskusi získaných výsledků a dalšího postupu. Prokázal vysokou zběhlost v ovládání počítačů i práce s různým programovým vybavením. Diskutoval osobně i s pracovníky firmy COMSOL, která vytváří a dodává stejnojmenný výpočetní balík, jenž byl jeho hlavním pracovním prostředkem. Zadání práce naplnil, s jeho výkonem jsem byl spokojen.

Posudek oponenta

Sedláček, Petr

Bc. Jakub Koláček se ve své diplomové práci zaměřil na vývoj simulačních modelů pro analýzu Brownova pohybu částic ve viskoelastickém prostředí, a to především (nikoliv výhradně) s použitím programu COMSOL Multiphysics. Předně bych rád zdůraznil, že jak téma, tak i zpracování a výstupy práce považuji za velmi originální a mimořádně zajímavé, navzdory tomu (nebo možná právě proto), že počítačová chemie zůstává na naší fakultě stále na okraji zájmu jak výzkumného, tak i pedagogického. Přestože se práce zaměřuje na poměrně složitou oblast fyzikální chemie a neobejde se, především v teoretické části, bez shrnutí nezbytného matematického aparátu, je autorem zpracována do textu, který zůstává dostatečně srozumitelný a čtivý. Členění práce je standardní – po stručném úvodu, prezentujícím hlavní motivaci a cíle práce autor shrnuje teoretické základy řešené problematiky. V této části, kromě již naznačené ohleduplnosti ke čtenáři při prezentování a vysvětlování rovnic, oceňuji i absenci častého nešvaru podobného typu prací, kterým je zbytečné plevelení teoretických kapitol balastním textem. Teoretická část předložené práce je stručná a zaměřuje se pouze na aspekty, které mají přímou souvislost s experimentální náplní práce. Orientaci čtenáře v textu usnadňuje také to, že autor vypíchl konkrétní vědecké poznatky, které sloužily jako inspirace pro autorovo vlastní bádání, do separátní kapitoly (Současný stav řešené problematiky). Z hlediska formálního jsem v práci nenašel žádné podstatné pochybení, za zmínku stojí snad jen odkaz na neexistující rovnici 1.3 (str. 16) . Hlavní devizou předložené diplomové práce je bezesporu její experimentální část. Autor navrhl a otestoval celou řadu originálních simulačních přístupů v rámci všech relevantních fází modelování analyzovaného transportního děje (základní definice modelu, návrh geometrie porézní struktury, implementace matematického aparátu pro popis viskoelasticity prostředí). Ne všechny navržené simulační přístupy se ukázaly jako vhodné, autor však velmi dobře vysvětluje, proč se ty které varianty rozhodl z další práce vyřadit a jak by bylo možné v budoucnu přistoupit k jejich optimalizaci. Mimořádné ocenění si zaslouží také to, že autor kladl důraz na to, aby byl výsledný model použitelný nejen v rámci jím realizovaných simulací, ale aby byl k dispozici i pro ostatní uživatele především – ale nejenom – v rámci jeho domovského pracoviště. Konkrétními výstupy práce jsou tak nejen grafické výsledky simulací (převážně v podobě MSD křivek), prezentované v kapitole Výsledky a diskuse, ale především velmi cenné simulační nástroje, které tvoří přílohy práce a jsou volně k dispozici nejen pracovníkům Fakulty chemické, ale i širší odborné veřejnosti na platformě GitHub. Předložená diplomová práce zpracovaná Bc. Jakubem Koláčkem dle mého názoru představuje mimořádně kvalitní autorské dílo s nezpochybnitelným dopadem na danou výzkumnou oblast. Pevně věřím, že se autorem vyvinutý simulační model stane cenný základem nejen pro podrobnější interpretaci výsledků relevantních experimentálních (např. mikroreologických) analýz, ale také pro další rozvoj počítačové chemie na Fakultě chemické. Práci doporučuji k obhajobě a hodnotím ji stupněm „Výborně (A)“.

eVSKP id 156714