LABOUNEK, R. Porovnávání mitochondriální DNA pro identifikaci druhů [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2010.
Student se v práci zabýval porovnáváním mitochondriálního genu COI pro identifikaci živočišných druhů. Teoretická část práce je zaměřena na popis mitochondrie a metody DNA barcodingu. Zpracování praktické části je rozsáhlé a splňuje zadání práce. Vytvořené grafické rozhraní a jednotlivé algoritmy jsou na velmi dobré úrovni. Student musel při zpracovávání práce nastudovat množství cizojazyčné literatury a v průběhu řešení projevil dostatek aktivity a samostatného přístupu. Z odborného hlediska je práce na velmi dobré úrovni. Menší výtky mám pouze k formálnímu zpracování, a to k několika gramatickým chybám a nevhodným formulacím týkajících se vztahu biologů k příkazovému řádku. Celkově hodnotím práci výborně a doporučuji ji k obhajobě.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Využití literatury | A | 10/10 | |
| Aktivita během řešení a zpracování práce (práce s literaturou, využívání konzultací, atd.) | A | 20/20 | |
| Splnění zadání | A | 50/50 | |
| Formální zpracování práce | B | 17/20 |
Student René Labounek se věnoval zajímavé a perspektivní problematice identifikace druhů metodou barcodingu podle molekulárních znaků. Podle zadání se zaměřil na mitochondriální DNA a využití mitochondriálního genu COI. Prostudoval známé metody zarovnávání molekulárních sekvencí a stručně je popsal. Sestavil příslušnou programovou jednotku zahrnující zarovnávací metody a metody porovnání sekvencí. Vše realizoval v prostředí Matlab. Vlastní práci lze vytknout poněkud nestandardní a méně srozumitelný popis. Text nemá logické členění ve formě: úvod, přehled problematiky, teoretický rozbor, návrh řešení, realizace, diskuse, závěr. Zejména popis řešení je skryt v popisu programového řešení v prostředí Matlab, které se pak jeví jako dominantní. V textu nejsou nikde uvedeny odkazy na použitou literaturu (vyjma převzatých obrázků). Nepředpokládám však, že by například Needelmanův-Wunschův algoritmus byl dílem autora. Práce má přesto svoji hodnotu a při jisté snaze lze v textu najít vše potřebné. Oceňuji prodrobný závěr, i když by měl být spíše nazván diskusí. Student splnil zadání v plném rozsahu a dosáhl vytčených cílů. Práci doporučuji k obhajobě a hodnotím známkou B.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | 19/20 | |
| Odborná úroveň práce | B | 40/50 | |
| Interpretace výsledků a jejich diskuse | A | 20/20 | |
| Formální zpracování práce | D | 6/10 |
eVSKP id 30673