SLANICAYOVÁ, E. Identifikace G-kvadruplexů pomocí bioinformatického nástroje v onkogenech a tumor supresorech [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2025.
Bakalářská práce se zaměřuje na identifikaci potenciálních G-quadruplexových sekvencí (PQS) v deseti onkogenech a deseti nádorových supresorových genech pomocí bioinformatického nástroje G4Hunter. Autorka provedla rozsáhlou analýzu výskytu, frekvence a distribuce G-quadruplexů a jejich možného vlivu na regulaci genové exprese. Výsledky ukazují nerovnoměrné rozložení PQS mezi onkogeny a nádorovými supresory, přičemž onkogeny vykazují vyšší frekvenci méně stabilních struktur. Práce tak přináší důležité poznatky o regulačním potenciálu G-quadruplexů a jejich možném terapeutickém využití. Práce splňuje všechny požadavky kladené na bakalářskou práci. Doporučuji ji k obhajobě a navrhuji hodnocení výborně (A).
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Závěry práce a jejich formulace | B | ||
| Využívání konzultací při řešení práce | A | ||
| Celkový přístup k řešení úkolů | A | ||
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Studium literatury a její zpracování | A | ||
| Využití poznatků z literatury | A |
Záverečná bakalárska práca Eleni Slanicayovej sa venuje predikcii výskytu, frekvencie a distribúcie potenciálnych kvadruplexových sekvencií vo vybraných onkogénoch, tumor supresorových génoch a v genóme Homo sapiens pomocou bioinformatického nástroja G4Hunter. Cieľom analýzy bolo vytvoriť základ pre možné budúce využitie G-kvadruplexových štruktúr v systémoch cielenej distribúcie liečiv v oblasti onkológie. Práca je vypracovaná na 47 stranách a čerpá zo 106 literárnych zdrojov, prevažne z aktuálnej zahraničnej odbornej literatúry. Teoretická časť je spracovaná komplexne a s vysokou mierou odbornosti, pričom autorka preukazuje schopnosť orientovať sa v zložitej problematike sekundárnych štruktúr DNA. Text poskytuje ucelený prehľad o G-kvadruplexoch, ich štruktúre, topológii, metódach identifikácie a význame v oblasti biomedicíny. Experimentálna časť sa opiera o dôsledne spracovanú bioinformatickú analýzu, do ktorej autorka zahrnula desať onkogénov, desať tumor supresorových génov a celý ľudský genóm. Za veľké pozitívum považujem rozsah analyzovaných vzoriek, ako aj samostatné spracovanie dát vrátane použitia vlastného skriptu na automatizáciu analýz. Práca je tematicky aktuálna a jej výstupy majú potenciálne uplatnenie v biomedicínskom výskume. Po formálnej stránke je práca logicky členená a tematicky konzistentná. Napriek tomu obsahuje viaceré formálne nedostatky. Typografické chyby sa prejavujú v nesprávnom použití pomlčiek, nedeliteľných medzier, nesprávnej úprave obrázkov, grafov a tabuliek, ako aj v chybných odkazoch na výsledky v diskusii práce. V texte sa vyskytujú aj preklepy, neúplné slová a nesprávne zapísané jednotky. Problematické je tiež nedodržanie citačných noriem (niektoré citácie sú neúplné alebo formálne nekonzistentné). Autorka taktiež v niektorých prípadoch používa anglické výrazy, ktoré by bolo vhodné preložiť do jazyka práce. Napriek uvedeným výhradám práca spĺňa všetky požiadavky zadania a uvedené nedostatky nemajú zásadný vplyv na jej odbornú hodnotu. Z uvedených dôvodov odporúčam bakalársku prácu k obhajobe a navrhujem hodnotenie A.
| Kritérium | Známka | Body | Slovní hodnocení |
|---|---|---|---|
| Splnění požadavků zadání | A | ||
| Logické členění práce | A | ||
| Kvalita zpracování výsledků | A | ||
| Interpretace výsledků, jejich diskuse | B | ||
| Využití literatury a její citace | B | ||
| Formální úroveň práce – celkový dojem | A | ||
| Závěry práce a jejich formulace | A | ||
| Úroveň jazykového zpracování | B |
eVSKP id 162647