FRANTIŠOVÁ, Z. Nástroj pro správu databáze sekvenčních typů patogenních bakterií [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2018.
Studentka Zuzana Františová se ve své práci zabývá vývojem bioinformatického výpočetního nástroje umožňujícím srovnání dat ze dvou rozdílných metod pro typizaci patogenních bakterií. V práci nejprve pojednává o základních molekulárně-biologických laboratorních technikách relevantních pro techniky bakteriální typizace a následně pak o samotných technikách typizace. Celá rešerše je podložena velkým množstvím cizojazyčné literatury a na úroveň bakalářského studia je nadstandardně kvalitní. V rámci navazující praktické části studentka navrhla a realizovala nástroj pro správu databáze umožňující porovnání dat ze dvou typizačních metod pomocí unikátního převodního klíče, který se používá v centru molekulární biologie FN Brno. Díky pravidelným návštěvám tohoto pracoviště se jí podařilo vytvořit maximálně uživatelsky přívětivý software a databázi, které jsou nyní využívány v nemocničním laboratorním provozu. Na konci práce studentka přidává statistické zhodnocení unikátnosti identifikace sekvenčního typu bakterie pomocí levné techniky minim typing pro všech 5 bakterií, které v současnosti databáze obsahuje. Z odborného hlediska je práce tedy velmi kvalitní. O tom svědčí i fakt, že za práci spojenou s tímto tématem byla studentka oceněna v rámci fakultního rozvojového projektu „Podpora talentovaných studentů“ jako jedna z pouhých tří studentů bakalářského studia. Byť po celou dobu studentka pracovala maximálně samostatně, pravidelně své výsledky konzultovala a při kontrole rozpracovanosti již byla práce téměř kompletní. Díky tomu odstranila i formální nedostatky a až na jediný překlep a horší kvalitu obrázků v tištěné verzi nemám k práci připomínek. Práci proto doporučuji k obhajobě a hodnotím jako výbornou.
Studentka Zuzana Františová vypracovala velmi kvalitní bakalářskou práci, jejímž cílem bylo vytvořit uživatelskou aplikaci pro správu databáze sekvenačních typů patogenních bakterií. Práce vznikla v přímé spolupráci s externím pracovištěm a reflektuje současné potřeby v laboratorní praxi. Celá práce je přehledná, srozumitelná a výstupem je hodnotný nástroj, který bude externím pracovištěm využíván. Z formálního hlediska bych vytkla jen pár překlepů a gramatických chyb, či že obr. 1.1. a 2.4 mohly být v lepší kvalitě. Z odborného hlediska výtek nemám. Způsob řešení je velmi dobře popsán včetně vývojových diagramů jádra navržené aplikace. Oceňuji propojení aplikace vytvořené v Matlabu s databází MS Access a také statistickou analýzu současného obsahu databáze sekvenačních typů pěti druhů bakterií. Zadání práce bylo bezezbytku splněno. Práci doporučuji k obhajobě s hodnocením A, 95 bodů.
eVSKP id 110495