KHÝROVÁ, M. Využití techniky AFM při studiu biologických vzorků [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2022.

Posudek vedoucího

Slaninová, Eva

V rámci své bakalářské práce se studentka Markéta Khýrová zabývala využitím techniky AFM při studiu biologických vzorků. Konkrétně studentka studovala morfologii gram negativních bakterií schopných produkce a akumulace polyhydroxyalkanoátů, které porovnávala s mutantním kmenem bez této schopnosti. Své bakalářské práci se studentka věnovala opravdu s velkým zájmem a nadšením. Studentka odvedla skvělou práci v hledání a aplikaci potřebných informací, které byly nezbytné pro zavedení techniky AFM na fakultě chemické při studiu mikroorganismů. S danou technikou studentka pracovala opravdu s výjimečnou zručností a na základě získaných zkušeností si sama inovovala postupy přípravy vzorků. Rovněž zpracování textové části bylo bez problémů, jelikož dodržovala všechny domluvené termíny. Na základě výše uvedeného doporučuji práci k obhajobě a hodnotím ji známkou A.

Posudek oponenta

Smilek, Jiří

Bakalářská práce Markéty Khýrové je tematicky zaměřena na využití, možná lépe řečeno, optimalizaci měření na mikroskopu atomárních sil ke studiu gram-negativních bakterií, ve většině případů schopných produkovat polyhydroxyalkanoáty. Nutno podotknout, že se jedná o průkopnickou práci v tomto výzkumném směru, která ještě na Fakultě chemické nebyla v podobném ražení realizována. Závěrečná práce Markéty Khýrové je velmi kvalitně sepsána bez zásadnějších typografických, věcných či formálních nedostatků. Soudě dle kvality závěrečné práce je patrné, že studentka se se zadanou problematikou popasovala na výbornou. V teoretické části dokázala zdatně popsat nejenom materiály, se kterými při vypracování bakalářské práce pracovala, ale také princip mikroskopie atomárních sil. Výše uvedené svědčí o kvalitní připravenosti studentky z teoretického hlediska. Rešeršní část, která je součástí teorie (osobně preferuji, když je současný stav řešené problematiky samostatnou kapitolou, ovšem to je otázkou vkusu a rozhodně to nesnižuje kvalitu rešeršní části, natož tak kvalitu celé závěrečné práce) zaměřila na možnosti imobilizace biologických vzorků při měření na mikroskopu atomárních sil. Oceňuji, že znalosti nabyté studiem literatury dokázala přetransformovat do experimentální části, což u mnohých prací podobného charakteru není vždy pravidlem. V experimentální části obratně popisuje kultivaci bakterií a jejich následnou charakterizaci z hlediska množství vyprodukované biomasy a množství PHB. Optimalizaci metody mikroskopie atomárních sil je, na úkor výše uvedeného, věnován menší prostor, což považuji za trochu nešťastné, vzhledem k tomu, že se jednalo o gró celé práce. Na druhou stranu nutno podotknout, že rozsahově (množstvím experimentálních dat) práce převyšuje standardní bakalářské práce, což může být právě jedním z důvodů, proč je optimalizační část AFM poněkud kratší. Výše uvedené není považováno za kritiku, jedná spíše o doporučení pro navazující VŠKP. I přes kratší rozsah obsahuje optimalizační část takřka všechno podstatné. Ve výsledkové a diskuzní části studentka velmi obratně a s logickou návazností popisuje naměřená experimentální data. Částečně se snaží i korelovat získané informace napříč celou práci (např. množství vyprodukovaného PHB a výška bakterií získaných skenováním na AFM). Jedna z mála věcí, která by se dala práci vytknout je občasná snížená kvalita obrázků, např. důležité silové křivky na obr. 23 a 24 jsou opravdu nepřehledné. Dále bych také doporučoval přesunout kapitolu 4.3.3 věnující se nastavení parametrů měření do experimentální části práce. Nutno poznamenat, že Markéta Khýrová vypracovala velmi kvalitní práci, prokázala, že je zdatná v práci s odbornou literaturou a že je schopna naměřené výsledky kvalitně interpretovat a diskutovat. V průběhu řešení své bakalářské práce prokázala i experimentální zručnost a vytrvalost, z vlastní zkušenosti vím, že mikroskopie atomárních sil opravdu není jednoduchou metodou především, chcete-li měřit ve vodném prostředí. I proto práci hodnotím stupněm „A – výborně“ a po zodpovězení otázek oponenta doporučuji k obhajobě.

eVSKP id 139135