VEČERÍKOVÁ, P. Využití optických a mikrofluidních technik k analýze a separaci mikrobiálních buněk [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická. 2023.

Posudek vedoucího

Samek,, Ota

Předložená práce se zabývá experimentálně náročnou a velmi aktuální oblastí směřující k mikrobiologickým a biotechnologickým aplikacím. Cílem experimentálního snažení je studium tvorby PHA a alginátů v buňkách vybraných bakterií - Janthinobacterium lividum a Azotobacter vinelandii. Metody použité v této práci, které jsou založeny na Ramanově spektroskopii, umožnují rychlou analýzu buněk bez snížení jejich viability. Experimentální výsledky v této oblasti je třeba brát jako samostatný tvůrčí příspěvek k dalšímu pokroku ve výběru analytických technik pro sledování produkce PHB a alginátů v bakteriích. Přínosem jsou výsledky plynové chromatografie, které prokázaly obsah PHB v buňkách a umožnily srovnání s výsledky, které byly dosaženy Ramanovou spektroskopií. Byl identifikován Ramanovský „otisk“ alginátů sloužící k jejich identifikaci v buňkách. Diplomantka uplatnila znalost vyhodnocování výsledků pomocí techniky hlavních prvků (PCA) a poté určila markery pro následné třídění kultur obsahující pigmenty. Diplomantka pracovala samostatně a velmi pozorně nastudovala použité techniky. Precizně zvládla teoretickou část a i s experimentální částí si poradila naprosto bezchybně, s citem zkušeného experimentátora získávala experimentální data. Je zřejmé, že při řešení tématu diplomantka získala potřebné teoretické a experimentální znalosti k dalšímu rozvoji tohoto náročného výzkumu. Z prezentace získaných výsledků je vidět, že studentka je schopná samostatně řešit experimentální a teoretické problémy. Diplomantka se svého úkolu zhostila se ctí a na výborné úrovní, a proto tuto práci hodnotím klasifikačním stupněm A-výborně.

Posudek oponenta

Bernatová,, Silvie

Studentka Bc. Paula Večeříková předkládá diplomovou práci s názvem Využití optických a mikrofluidních technik k analýze a separaci mikrobiálních buněk. Práce je standardně dělena na tři základní části: 1. Teoretická část, 2. Experimentální část a ve 3. části uvádí dosažené výsledky a diskuzi nad nimi. Na přibližně 46 stranách textu (včetně obrázků) je použito 89 referenčních zdrojů. Studentka dle zadání diplomové práce provedla literární rešerši na téma využití Ramanovy spektroskopie a příbuzných technik k analýze buněk a na téma mikrofluidní techniky pro separaci buněk, kterou studentka zařadila do části nazvané Teoretická část. Studentka se této části zhostila velmi dobře, rešerše je úderná, čtivá a nezabíhá do zbytečných detailů. Pro nezasvěceného čtenáře představuje tato část úvod do problematiky včetně motivace k následné experimentální činnosti. Jedinou výtku, kterou mohu uvést je fakt, že jsem v textu nenašla odkazy na některé reference (např. 68,69,70, 74 a 75). V Experimentální části studentka popisuje experimentální procedury, instrumenty, přípravy vzorků atd. K této části mám drobné výhrady spíše formálního charakteru, např: 1) Autorka uvádí maximální výkon laserů, ale neuvádí výkon, při kterém byl experiment realizován (pravděpodobně při maximálním výkonu). 2) Autorka používá nevysvětlené zkratky (str. 23, není jasné, co je zkratka DPSS). 3) Autorka neuvádí typ mikroskopového objektivu použitého v případě ramanovské mikro-spektroskopie (uvádí pouze zvětšení objektivu) atd. V části Výsledky měření a diskuze autorka uvádí dosažené experimentální výsledky, jejich zpracování a diskuzi nad výsledky. V této části jsem nalezla několik formálních chyb, především špatné zaokrouhlení výsledku (např. str 45). Chtěla bych zdůraznit, že v této části studentka nad vší pochybnost prokázala, že je schopna samostatného a kritického zpracování experimentálních dat. Diskuze výsledků je velmi povedená a autorka využívá již opublikované výsledky pro podporu svých tezí. Autorka prokázala, že je schopna sama z naměřených dat vyvodit relevantní závěry a kriticky se zamýšlí nad vlivem měřici metody na úrovni začínajícího vědeckého pracovníka. Dále sama navrhuje možný postup pro rozklíčovaní nesouladu s předpokládanými výsledky. Dle mého názoru několik drobných nedostatků je vyváženo brilantní diskuzí dosažených výsledku a z tohoto důvodu navrhuji práci k obhajobě a nejvyšší možné hodnocení.

eVSKP id 148927