TĚTHAL, J. Fuzzy klasifikace DNA sekvencí [online]. Brno: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií. 2013.
Student Jiří Těthal se ve své diplomové práci věnoval využití fuzzy logiky v analýze DNA sekvencí. Sestavil ucelený přehled klasifikátorů DNA sekvencí vyhodnocujících jak strukturální podobnost, tak příbuznost organizmů. Vhodnou kombinací fuzzy logiky a těchto klasifikátorů navrhl techniku pro popis kódujících a nekodůjících úseků sekvencí. Dále se zaměřil na zpřesnění identifikace organismů v DNA barcodinu pomocí fuzzy klasifikace což demonstruje na třech rozsáhlých setech DNA sekvencí různých řádů a druhů. Vyhodnocení úspěšnosti klasifikace je však nepřehledné a na zvolených datech je zlepšení klasifikace poměrně neprůkazné. Odborná stránka práce obsahuje řadu nepřesností, u některých hodnotících parametrů není dobře popsáno, jak byly stanoveny. Po formální stránce je práce až na horší kvalitu některých obrázků na dobré úrovni. Student přistupoval k práci aktivně, pracoval samostatně a své výsledky pravidelně konzultoval. Celkově hodnotím práci za B – 87 bodů.
Student v předložené diplomové práci splnil všechny body zadání. Po formální stránce lze vytknout horší čitelnost obrázků 1 až 6, chybějící čárky ve větách a jiné pravopisné chyby. Některé části textu jsou téměř zbytečné, u některých podkapitol by bylo vhodnější problematiku rozšířit, např. 3.1.1 Sekvenování DNA s tabulkou kódování DNA, která je vložena bez kontextu. V praktické části práce jsou některé popisy práce tak stručné, že jsou málo srozumitelné. Práce obsahuje také nepřesnosti a jistou zmatečnost, např. pro zarovnávání sekvencí byla použita substituční matice BLOSUM30, která je však určena pro aminokyseliny a ne nukleotidy. Při testování fuzzy klasifikace sekvencí do druhů chybí alespoň základní analýza variability uvnitř druhů, která má na výsledky jistě výrazný vliv. I přes uvedené výtky obsahuje práce zajímavé výsledky.
eVSKP id 65511